擴增子測序是一種高靶向性地分析特定基因

組區域中基因變異的方法，是發現單核苷酸多態性

(single nucleotide polymorphisms，SNPs)的理想方

法。其利用 PCR 的引物來擴增基因組的特定區域，

靶向地捕獲目標區域的 DNA，達到目的 DN**段

的富集目標；針對擴增產物(也被稱為擴增子)

進行高通量測序，分析序列中的遺傳變異等信息。

一般認為，核糖體 RNA (rRNA)基因存在于所

有細胞生物體中，由于很少發生大規模的橫向基因

遷移，因此具有一系列由非常保守到高變的區域，

適合于微生物分類信息的確定。由于核糖體操縱子

具有足夠的保守性，因此常被用作多樣性調查的標

記基因，主要包括 16S rRNA、18S rRNA 和轉錄

間隔區(internal transcribed spacer，ITS)等。 上海融享生物科技有限公司主營測序包括 18S 價格優惠。浙江古細菌16S測序公司

擴增子測序是對特定長度的PCR產物或者捕獲的片段進行測序，目前主要是應用高通量測序技術對特定環境中特定遺傳物質進行測序，如原核生物16S rDNA/rRNA，真核生物18S rDNA/rRNA或者rDNA-ITS,這些特定的遺傳物質都包括進化保守性及進化可變區，因此通過對這些可變區的測序和比對分析，可以克服培養技術的缺點，獲得不能分離培養的物種信息，從而精確地探究并揭示不同環境中物種的多樣性。擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序，分析序列中的變異。16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA，選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域，通過檢測目標區域的序列變異和豐度，以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。技術優勢1、通量高，適用于大量樣本的特定基因組區域研究2、周期短，可縮短研究周期，加速臨床應用及文章發表3、信息度高，針對感興趣的基因組區域進行遺傳變異位點的尋找，可對特定區域進行深入研究上海ITS測序18S 多種測序供您選擇。

精確的方法當數 ＤＮＡ 測

序技術，但存在耗時長、費用高等缺點的限制，無法應用于臨床

進行常規 檢 測。現 常 用 方 法 仍 是 ＰＣＲ、ＲＦＬＰ、ＳＳＣＰ 等 技

術。在早期采用的方法是 ＰＣＲ 擴增之后直接電泳，比 較 電 泳

圖譜差異進行細菌種屬的鑒定；如果 ＰＣＲ產物單一，可以利用

ＲＦＬＰ得到不同的酶切片段加以分析或單鏈構相多態性（ＳＳ－

ＣＰ）加以區分。而１６ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基 因 間 區 與 某 些 基 因（如

ｍｅｃＡ 基因、ｏｍｐ２５和ｏｍｐ３１基因等）聯合進行細菌鑒定，與電

導技術相結合或與人工神經網絡技術（ＡＮＮ）相結合進行細菌

鑒定等均可提高鑒定的靈敏度和特異度。

有了微生物 16S rRNA 基因序列, 不論是全長還是部分, 都可以提 交到 GENBANK 采用 BLAST 程序與已知序列進 行相似性分析。GENBANK 將按照與測得序列的 相似性高低列出已知序列名單、相似性程度以及 這些序列相對應的微生物種類, 但更為精確的微生物分類還取決于系統發育分析。系統發育分析, 就是根據能反映微生物親緣關系的生物大分子 (如 16S rDNA、ATP 酶基因)的序列同源性, 計算 不同物種之間的遺傳距離, 然后采用聚類分析等 方法, 將微生物進行分類, 并將結果用系統發育樹 (phylogentic tree)表示。計算菌屬、菌種之間的遺 傳距離可以采用不同方法, 如 Jukes Cantor 方法。 在計算遺傳距離之后, 構建進化樹時有許多種方 法, 其中以 NeighborJoin 法為常用。在進行系統 發育樹分析時常用到的一些軟件包括 MEGA 和 Phylip 等 。上海融享生物科技有限公司專業 18S 公司。

１６ＳｒＲＮＡ 基因結構特點及序列分析的基本原理 １６Ｓ

ｒＤＮＡ 基因是細菌染色體上編碼１６ＳｒＲＮＡ 相對應的 ＤＮＡ 序 列，其可變區與恒定區序列交錯排列。恒定區在各種細菌中基

本保持不變，而可變區因不同細菌，不同科、種、屬而異，且變異

程度與細菌的系 統 發 育 密 切 相 關。相 比 之 下，５ＳｒＲＮＡ 雖 易

分析，但核苷酸少，沒有足夠的遺傳信息用于分類研究；而２３Ｓ

ｒＲＮＡ 含有的核苷酸數幾乎是 １６ＳｒＲＮＡ 的 ２倍，分 析 較 困

難，故以１６ＳｒＲＮＡ 作為研究對象較為理想。 ITS 的多種測序總有一款是您滿意。浙江古細菌16S測序公司

您知道上海融享生物科技有限公司的 18S ITS都有哪些嗎？浙江古細菌16S測序公司

ITS1 或 ITS2 究竟哪

個片段能更好地反映群落組成仍存有爭議。

ITS1 通常比 ITS2 短，對物種分辨率低一些，但是

擴增和測序錯誤也低一些；ITS2 分辨率高，但是測

序的誤差會增加 OTU 的數量。研究表明，在不同

的生態環境和群落復雜性下，ITS1 和 ITS2 測序結

果反映的群落組成既存在一致性，也存在差異性。

例如，在部分土壤和外生菌根群落研究中，

ITS1 和 ITS2 呈現出了相似的結果；而在部分土壤

和人類腸道群落研究，ITS1 和 ITS2 的結果則

存在差異。我們的結果表明，針對 ITS2 片段的

擴增引物覆蓋度均高于針對 ITS1 片段的擴增引物。

總之，這些結果表明，群落結構研究所關注的

標記基因片段和引物選擇尚未標準化。 浙江古細菌16S測序公司