DNA甲基化即在DNA上增加甲基基團，是使基因的轉錄抑制或沉默的主要方式。該修飾特異性地發生在CpG位點，胞嘧啶通過磷酸鹽與鳥苷酸連接(圖1)。甲基基團的插入改變了DNA的表觀和結構，可能會直接阻礙DNA的識別及與轉錄因子的結合，或者吸引其他因子優先與DNA結合，干擾轉錄因子的結合。目前已鑒定了三個與甲基化DNA結合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso樣蛋白、以及SRA蛋白。通過招募這些蛋白，DNA甲基化可促進某些組蛋白狀態的維持，如去乙酰作用，從而保持轉錄后的組蛋白修飾。例如，MBD家族的甲基CpG結合蛋白2(MeCP2)與甲基CpG結合，招募HDACs，可促使染色體濃縮和轉錄抑制。DNA復制后胞嘧啶的甲基化會改變DNA的構象，使DNA的大溝無法與DNA結合蛋白正常結合。上海目標區間甲基化重測序分析

全基因組重亞硫酸鹽甲基化測序（WGBS）可以在全基因組范圍內精確的檢測所有單個胞嘧啶堿基（C堿基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金標準。WGBS能為基因組DNA甲基化修飾的研究提供重要技術支持，能廣泛應用在個體發育、衰老和cancer發生等生命過程的機制研究中。其原理是用 Bisulfite 處理DNA序列，首先將基因組中未發生甲基化的 C 堿基轉換成U（T），從而與原本具有甲基化修飾的堿基C區分開來，然后進行PCR擴增，結合高通量測序技術，適用于全基因組范圍內繪制單堿基分辨率的DNA 甲基化圖譜。甲基化重測序哪個公司做DNA甲基化主要發生在CpG位點。在哺乳動物中，70%到80%的CpG位點的胞嘧啶是甲基化的。

DNA甲基化是指在DNA甲基轉移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子發生甲基化的生物化學過程。DNA胞嘧啶甲基化是一種穩定的表觀遺傳學標記，在調控特定基因表達、轉座子沉默、基因印記、X染色體失活以及基因組穩定性等多種生物學過程中發揮著重要作用。在動物中，DNA甲基化主要發生在CpG二核苷酸的背景下，約為70-80%的DNA甲基化。然而，剩余未發生甲基化的CpG位點則主要密集分布于基因的啟動子區域和the first exon region，被稱為CpG島(CpG island)，在基因表達的調控和基因突變上都可能發揮著重要作用。

上海翼和生物甲基化測序采用的是重亞硫酸鹽擴增子測序法（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS），重亞硫酸鹽轉化是研究DNA甲基化的金標方法，該技術基于非甲基化胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的化學轉化，即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA，非甲基化胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化胞嘧啶不發生這種轉化，從而能夠在單核苷酸水平上確定DNA甲基化（圖1）。轉化后的序列可以進行多種分析，包括重亞硫酸鹽測序、焦磷酸測序、甲基化特異性PCR、高分辨率熔解曲線分析、基于微陣列的方法和下一代測序。DNA甲基化是研究**為普遍的表觀遺傳修飾，它被認為在許多生物學過程和疾病中有著重要的作用。

Hi-Methylseq結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術，可實現多區段、多位點的甲基化精確定量分析，適用于感興趣的目的片段的甲基化研究和在大樣本中進一步確認全基因組甲基化研究挑選的陽性位點。采用翼和自主知識產權的多重PCR捕獲技術，確保目的片段有效富集，經亞硫酸氫鹽處理后，DNA序列復雜度嚴重降低，嚴格控制建庫PCR的循環數，降低非特異性擴增，通過將參考序列中的C堿基全部替換為T堿基，然后將測序reads比對到轉換后的參考序列上，針對每一個CpG位點，統計C和T堿基的讀數（類似于SNP calling），來判斷該位點的甲基化。DNA甲基化在DNA復制起始、錯配修復以及轉座子的失活等過程中對維持遺傳信息的穩定性發揮著重要的作用。安徽目標甲基化重測序怎么解決

DNA甲基化分析是經過亞硫酸氫鹽處理后，用PCR擴增目的片段，并對PCR產物進行測序.上海目標區間甲基化重測序分析

DNA去甲基化分為兩類：主動去甲基化（Active DNA Demethylation）和被動去甲基化（Passive DNA Demethylation）。基因組甲基化模式的形成主要依賴于主動去甲基化，主要涉及一類具有DNA去甲基化功能的蛋白，可能存在的五種機制a. DNA轉葡糖基酶參與的堿基切除修復（base excision repair；BER）：5-mC 由DNA 轉葡糖基酶直接去除。此途徑主要存在于植物體內，動物體內也可能存在。b.脫氨酶參與的堿基切除修復：5-mC 脫氨變成胸腺嘧啶T，形成G/T 錯配，進入BER 途徑。這一途徑主要存在于動物體中，植物體中也可能存在。c.核苷酸外切修復機制（nucleotide excision repair；NER）：直接移除甲基化的CpG 二核苷酸。d.氧化去甲基化：發生氧化反應打開碳-碳鍵，直接去除甲基基團。e.水解去甲基化：水解胞嘧啶的甲基基團，使其以甲醇的形式被釋放。DNA被動去甲基化是指當DNMTs活性被抑制或濃度過低時，無法維持原有的甲基化狀態，使DNA甲基化程度降低的過程，這類去甲基化通常發生在細胞復制的兩個周期之間，涉及到某些可與DNMTs結合的因子，其結合后形成的復合物可以阻止DNMTs與DNA的結合。上海目標區間甲基化重測序分析

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