競爭性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國LGC（**化學家實驗室）公司所開發的技術，被比較常見用于少位點，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels(InsertionsandDeletions，插入和缺失)。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，是上海市****，至今已有十六年歷史,專注于為國內科研工作者和生物醫藥企業提供各類分子遺傳學技術服務（高同源區段SNP分型）和質控試劑盒。在進行基因組研究中經常會遇到各類高同源區段，比如人基因組中P450基因家族，HLA基因座位。北京同源序列SNP分型報告

上機測序后，每個樣本同一個SNP位置可以讀到數十或數百條reads（具體取決于測序通量），并且能夠清晰看到每條序列的具體信息，通過對SNP位點的聚類分析，實現位點基因型的判斷。大規模樣本中二等位基因reads比分布結果，每一個點**一個樣本一個SNP位點的聚類結果，兩端表示純和，中間表示雜合（理想情況，1/0表示純和，0.5表示雜合）。上海翼和應用生物技術有限公司上海翼和**團隊富有開創精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業、協作、進取”的企業精神，為科研用戶提供性價比高、高質量可靠的遺傳學技術服務和產品。微信公眾號：上海翼和生物天津高同源序列SNP分型準確度高組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成。

Hi-SNP 結合多重 PCR 技術和高通量測序技術，對需要檢測的位點設計特異性引物，在單管內進行多重 PCR 擴增，不同的樣本以不同的 Barcode 引物區分。混合樣本后，在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺上， 對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法，區分不同的樣本，**終獲得每個位點的 SNP 信 息。高通量測序能一次對幾百萬條 DNA 分子進行序列測定，相比其他的 SNP 檢測技術，基于高通量測序的 SNP 分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物。

網絡版本的NCBI在內的很多網站都提供了在線的blast服務，是**經常用到的blast服務。網絡版本的NCBI優點：方便，容易操作，數據庫同步更新等優點。網絡版本的NCBI缺點：不利于操作大批量的數據，同時也不能定義搜索的數據庫。單機版本的NCBI   通過NCBI的ftp站點獲得。獲得程序的同事必須取相應的數據庫才能在本地進行BLAST分析。單機版本的NCBI優點：可以處理大批的數據，可以自己定義數據庫。單機版本的NCBI缺點：需要耗費本地機的大量資源，此外操作也沒有網絡版直觀、方便，需要一定的計算機操作水平。現階段，異源多倍體物種的全基因組重測序已經可以通過各式各樣的生信算法，SNP的質量也越來越好了。

多序列比對的意義：用于描述一組序列之間的相似性關系，以便了解一個基因家族的基本特征，尋找motif，保守區域等。用于描述一個同源基因之間的親緣關系的遠景，應用到分子進化分析中。多序列比對的方法：同源性分析中常常要通過多序列比對來找出序列之間的相互關系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比對大多都是采用全局比對的算法。這樣對于采用計算機程序的自動多序列比對是一個非常復雜且耗時的過程，特別是序列數目多，且序列唱的情況下。多重長片段PCR技術，結合了長片段PCR和多重PCR的優勢，是解決多個高同源區段SNP分型分析的有效手段。山東同源區段SNP分型送樣要求

只要這個突變群沒有達到總群體的1%，它就只是一個突變株/系。達到了1%就是多態性了。北京同源序列SNP分型報告

1. SNP數量多，分布比較常見。據估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中，根據SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規模化篩查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態的標記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標準曲線，然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較，根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態性，也有利于對其進行基因分型。北京同源序列SNP分型報告

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