基因的直系同源、旁系同源或異源同源關系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個物種；伴隨物種分化而進行的兩次基因重復共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個基因互為異源同源。然而，B1和B2、B2和C1又是什么關系呢?在這個問題上曾引起爭議。B1和B2、B2和C1的分離是由于***次基因重復而產生的，套用定義，可得出B1和B2、B2和C1互為旁系同源。同理，B1和C2/C3、C1和C2/C3也互為旁系同源。類似的，根據直系同源基因的定義，B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互為直系同源。SNP分型遇到高同源區段怎么辦？翼和生物自主研發多重長片段巢式PCR技術，解決高同源區段SNP分型難題。上海高同源序列SNP分型分析

連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別，高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配，連接反應就不能進行。該方法，對SNP位點同時設計兩條有長度差異的探針，當探針末端與模板有一個堿基不配對，所以連接反應不能進行，沒有連接產物；相反，若探針與模板DNA完全互補，故進行連接反應，通過溫控循環，該特異性連接反應可反復進行，達到線性擴增的效果。，后通過熒光掃描片段長度，實現對SNP位點的檢測。上海高同源序列SNP分型分析翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案，有效解決了高同源區段SNP/序列分析的難題。

上海翼和生物基于自主知識產權的多重PCR捕獲技術，結合特色的生信分析方法，開發了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結果進行有效拆分，準確地將測序reads比對到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對多倍體物種進行SNP精細分型。應用方向農口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發現優良等位變異；開發功能標記；定制育種Panel；分子標記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評價；群體遺傳結構分析。

1. SNP數量多，分布比較常見。據估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中，根據SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規?；Y查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態的標記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標準曲線，然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較，根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態性，也有利于對其進行基因分型。二代測序SNP分型，針對同源片段數量比較少的區段，PCR擴增后建庫時，隨機抽樣抽到目的片段的概率比較高。

主要是指同源蛋白質的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比，比對出其相似的程度。相似度越高，說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，至今已有十六年歷史，專注于為國內科研工作者和生物醫藥企業提供各類分子遺傳學技術服務和質控試劑盒?；谧灾髦R產權的多重PCR技術，翼和生物研發和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術和產品，逐步形成了在細胞組織和動物模型質控、大健康檢測和科學研究3大板塊產品布局。由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.江蘇高同源序列分型機構

在進行基因組研究中經常會遇到各類高同源區段，比如人基因組中P450基因家族，HLA基因座位。上海高同源序列SNP分型分析

RFLP法的優點是分型技術簡單，結果判斷容易，不需要昂貴的設備，成本低，并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠導致RFLP的概率低，很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測，而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高，容易出現假陽性結果，且工作量大，耗時長，通量低。這是早期的一種SNP分型技術，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術目前只在個別實驗室中還在使用中。上海翼和應用生物技術有限公司上海高同源序列SNP分型分析

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