1. SNP數量多，分布比較常見。據估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中，根據SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規模化篩查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態的標記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標準曲線，然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較，根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態性，也有利于對其進行基因分型。根據高同源區段位點數量，提供多重長片段巢式PCR-LDR SNP分型和多重長片段巢式PCR-NGS SNP分型兩種解決方案。江蘇同源序列SNP分型怎么解決

在研究親緣關系較遠的物種時，物種分化和基因重復的嵌套發生使研究具有很大的復雜性和困難度。這時，籠統的劃分直系同源和旁系同源關系并不足以解決問題，我們需要一個更為精確的分類。為了區別于B1和C1的簡單的直向同源關系，把B2和C2/C3的同源稱為“共生直向同源”co—ortholog)或“橫向同源基因家族譜系特異性擴充”(1ineage—specificexpansionofparalogousfamily)。為了區分C2和C3、B1和C2/C3這兩種同源關系，可以根據物種分化和基因重復的發生的先后次序，把旁系同源基因又分為內旁系同源基因（inparalog）和外旁系同源基因（outparalog）。在物種分化之后產生旁系同源基因的稱“內旁系同源基因”；在物種分化之前產生橫旁系同源基因的稱“外旁系同源基因”。“內旁系同源基因”和“外旁系同源基因”只是一種相對的劃分，取決于所研究的系統和選作標準的某特定分化事件。若以第二次物種分化為準線，則C2和C3的分離發生在物種分化之后，因此它們互為內旁系同源基因；B1和C2/C3的分離發生在物種分化之前，因此B1和C2/C3互為外旁系同源基因。南京同源區段SNP分型哪個公司做SNP在基礎研究領域發揮著巨大作用。

SNP基因分型技術原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段，主要特點是準確性高、靈活性強、通量大，主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段，然后通過序列特異性引物實現單堿基延伸，隨后樣品分析物與芯片基質共結晶后在真空管中受瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子，由于電場中離子飛行時間與離子質量成反比，通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時間而獲得樣品分析物的精確分子量，從而檢測出SNP位點信息。

連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別，高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配，連接反應就不能進行。該方法，對SNP位點同時設計兩條有長度差異的探針，當探針末端與模板有一個堿基不配對，所以連接反應不能進行，沒有連接產物；相反，若探針與模板DNA完全互補，故進行連接反應，通過溫控循環，該特異性連接反應可反復進行，達到線性擴增的效果。，后通過熒光掃描片段長度，實現對SNP位點的檢測。高同源區段在多倍體物種中，又細分為橫向同源和部分同源。

Hi-SNP結合多重PCR技術和高通量測序技術，對需要檢測的位點設計特異性引物，在單管內進行多重PCR擴增，不同的樣本以不同的Barcode引物區分。混合樣本后，在Ion Proton/Ion Torrent平臺上，對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法，區分不同的樣本，，終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進行序列測定，相比其他的SNP檢測技術，基于高通量測序的SNP分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物提供高同源區段SNP分型服務。

目前在nature genetics和cell這樣的雜志，也不乏SNP的文章。上海高同源SNP分型報告

普通的二代測序SNP分型，利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs，難度比較高。江蘇同源序列SNP分型怎么解決

隨著二代測序技術的普及，相比Sanger測序，二代測序雖然降低了測序讀長，但是**增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型，不僅測序讀長滿足分型需求，并且可以同時對數十數百個位點，上千樣本進行分型。二代測序結果判斷準確直觀，相比RFLP，Taqman，LDR等方法都通過間接結果來進行分型結果的判定，直接測序或二代測序法分型能都直接看到位點具體序列情況，SNP位點判斷更加直觀。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，是上海市****，至今已有十六年歷史。江蘇同源序列SNP分型怎么解決

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