上海翼和生物根據具體實驗規模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務。PCR-LDRSNP分型服務:PCR-LDR技術是PCR技術和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應)想結合的檢測技術。LDR是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應就不能進行,反之則可以進行連接反應。Hi-SNP結合多重PCR技術和高通量測序技術,對需要檢測的位點設計特異性引物,在單管內進行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區分。混合樣本后,在illumina等主流測序平臺上,對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法,區分不同的樣本,,終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進行序列測定,相比其他的SNP檢測技術,基于高通量測序的SNP分型具有更準確、更靈敏的特點。但是只要這個突變群沒有達到總群體的1%,它就只是一個突變株/系。達到了1%就是多態性了。山東STRSNP分型
二代測序法主要通過PCR的方法,對目標SNP位點進行特異性捕獲。為了提型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時對多個位點進行捕獲(可同時對1-100位點進行分型)。由于二代測序通量是足夠滿足數百數千樣本的同時測序,因此需要對不同的樣本添加的樣本標簽(Barcode),從而在后續數據分析過程中,能夠進行樣本拆分。因此在多重PCR完成輪多SNP位點捕獲后,需要進行第二輪PCR,在輪PCR產物的基礎上,添加樣本樣本標簽及測序接頭等序列。通過PCR條件優化,目前亦可實現一次反應,兩輪PCR接力完成的效果。浙江SSR基因SNP分型報告現在國外的趨勢更傾向于,對于某一疾病的重要候選基因.
TaqMan熒光探針法優點是操作簡單,準確性高(閉管進行,減少污染),判讀也很方便,認可度高;適合多樣本,少位點。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時較長,價格昂貴,為了保證探針的穩定質量,一般大家會選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個位點時適用,并且對樣本的質量要求較高,除了樣本無降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應用生物技術有限公司,地址:上海市松江區龍騰路1015弄中星創意園2號502
LDR連接酶檢測法優點是適用于任何多態性位點,基于雜交反應和連接反應,分型結果準確,可進行多重反應,性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續樣本的分型需求,提高實驗通量的同時降低分型單價。上海翼和應用生物技術有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應用生物技術有限公司對于PCR產物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。
片段長度多態性(限制性內切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴增目的片段DNA,擴增產物再用特異性內切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點分布不同,產生不同長度的DN*段條帶。上海翼和**團隊富有開創精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業、協作、進取”的企業精神,為科研用戶提供性價比高、高質量可靠的遺傳學技術服務和產品。微信公眾號:上海翼和生物SNP應該在群體中占一定的比例,比如至少是1%。山東STRSNP分型
目前已有多種方法可用于SNP檢測,如根據DNA列陣的微測序法、DNA芯片以及TaqMan系統等。山東STRSNP分型
隨著二代測序技術的普及,相比Sanger測序,以降低測序讀長的前提,極大增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,可以同時對數十數百個位點,上千樣本進行分型。該方法相比直接測序法,除了保留測序法的優點外,彌補了其通量不足的限制,二代測序分型法也正在快速在領域內推廣。無錫分公司(無錫翼和應用生物技術有限公司)地址:無錫市濱湖區梅梁西路138號七號樓一樓。微信公眾號:上海翼和生物山東STRSNP分型
上海翼和應用生物技術有限公司位于龍騰路1015弄中星創意園2號502。公司業務涵蓋細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務等,價格合理,品質有保證。公司將不斷增強企業重點競爭力,努力學習行業知識,遵守行業規范,植根于醫藥健康行業的發展。翼和生物立足于全國市場,依托強大的研發實力,融合前沿的技術理念,飛快響應客戶的變化需求。