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南京目標區段甲基化重測序技術服務

來源: 發布時間:2021-10-10

表觀遺傳學研究已經證實了特定基因區域的DNA甲基化修飾對于染色體構象、基因表達調控機制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學為關注的內容之一。Bisulfite處理能夠將基因組中未發生甲基化的C堿基轉換成U,進行PCR擴增后變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區分開來,再結合高通量測序技術,可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。特定物種的高精確度甲基化修飾模式的分析,必將在表觀基因組學研究中具有里程碑式的意義,并且為細胞分化、組織發育等基礎機制研究,以及動植物育種、人類健康與疾病研究奠定基礎。DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。南京目標區段甲基化重測序技術服務

在表觀遺傳中,DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環5號位的甲基化修飾,又稱作5-甲基胞嘧啶(5mC),是**常見的甲基化修飾方式,也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認為當DNA甲基化出現在基因啟動子區,就會抑制基因轉錄,從而起到負調控的作用。DNA甲基化的形成機制,包括從頭合成(de novo),甲基化的維持(Maintenance)和去甲基化(Demethylation),這些過程分別由不同的基因和通路調控。這些基因和通路在動植物中即保守,又有所區別。浙江CPG島甲基化重測序哪個公司做重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序(NGS)的結合。

DNA甲基化可以抑制基因表達。其機制是當DNA甲基化出現在啟動子區,其會強化啟動子序列的異染色質化(染色體擰巴在一起),而使轉錄起始復合物無法接近和結合,從而強化基因的轉錄抑制。只有保持開放性常染色質狀態的轉錄起始位點,才能保證轉錄起始蛋白復合物可接近并結合這個區域,從而保證基因的轉錄表達。當DNA甲基化出現在編碼基因不同區域的時候(上游,基因區或下游),其對基因表達的影響也是不同的。同時,DNA甲基化不僅只影響基因轉錄,實際上其與組蛋白修飾、DNA突變、小RNA表達等都有非常復雜的相互調控作用。

DNA去甲基化分為兩類:主動去甲基化(Active DNA Demethylation)和被動去甲基化(Passive DNA Demethylation)?;蚪M甲基化模式的形成主要依賴于主動去甲基化,主要涉及一類具有DNA去甲基化功能的蛋白,可能存在的五種機制a. DNA轉葡糖基酶參與的堿基切除修復(base excision repair;BER):5-mC 由DNA 轉葡糖基酶直接去除。此途徑主要存在于植物體內,動物體內也可能存在。b.脫氨酶參與的堿基切除修復:5-mC 脫氨變成胸腺嘧啶T,形成G/T 錯配,進入BER 途徑。這一途徑主要存在于動物體中,植物體中也可能存在。c.核苷酸外切修復機制(nucleotide excision repair;NER):直接移除甲基化的CpG 二核苷酸。d.氧化去甲基化:發生氧化反應打開碳-碳鍵,直接去除甲基基團。e.水解去甲基化:水解胞嘧啶的甲基基團,使其以甲醇的形式被釋放。DNA被動去甲基化是指當DNMTs活性被抑制或濃度過低時,無法維持原有的甲基化狀態,使DNA甲基化程度降低的過程,這類去甲基化通常發生在細胞復制的兩個周期之間,涉及到某些可與DNMTs結合的因子,其結合后形成的復合物可以阻止DNMTs與DNA的結合。如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或tumour,而且,生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。

DNA 甲基化是早發現的基因表觀修飾方式之一,可能存在于所有高等生物中。DNA 甲基化能關閉某些基因的活性,去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。甲基化的主要形式有5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鳥嘌呤。原核生物中CCA/TGG和GATC常被甲基化,而真核生物中甲基化發生于胞嘧啶。DNA 的甲基化是在DNA 甲基化轉移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5'端的胞嘧啶轉變為5'甲基胞嘧啶。這種DNA 修飾方式并沒有改變基因序列,但是它調控了基因的表達。DNA甲基化幾乎只存在于CpG二核苷酸上,是一個關鍵的表觀遺傳標記和基因表達調控因子。杭州目標區間甲基化重測序機構

全基因組DNA甲基化測序是用 Bisulfite 處理DNA序列。南京目標區段甲基化重測序技術服務

5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型,能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法,能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水平,快速準確鑒定出差異甲基化區域,有助于我們更加***深入地了解動、植物的甲基化模式和表觀調控機制,在動物行為、植物脅迫、植物性狀、胚胎發育、cancer疾病、生物標記物等方面具有普遍的應用。南京目標區段甲基化重測序技術服務

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