相信對(duì)研究遺傳學(xué)及相關(guān)方向的老濕和童鞋來說，SNP肯定是，不陌生的名詞，它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。大量存在的SNP位點(diǎn)，使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病相關(guān)的基因組突變。小明：濕兄，濕兄！老濕讓我找SNP位點(diǎn)，要怎么找呀？濕兄：淡定！說清楚問題~小明：我的課題不是將目標(biāo)區(qū)段鎖定在10號(hào)染色體的一個(gè)區(qū)段嘛，我需要從里面找出SNP位點(diǎn)來進(jìn)行大樣本分型，但是這位點(diǎn)怎么選才好呢？濕兄：那你可以先把區(qū)段內(nèi)的SNP位點(diǎn)下載下來。小E：我知道，我知道！組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成。上海微衛(wèi)星STRSNP分型準(zhǔn)確度高

競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國(guó)LGC（**化學(xué)家實(shí)驗(yàn)室）公司所開發(fā)的技術(shù)，被比較常見用于少位點(diǎn)，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels(Insertions and Deletions，插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司，微信公眾號(hào)：上海翼和生物。 總公司地址位于：上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502、508 ，此外，無錫設(shè)有分公司上海微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型報(bào)告一次研究的SNP大概有十幾個(gè)到幾十個(gè)，這是比較早期的做法。

1.TaqMan探針法針對(duì)染色體上的不同SNP位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)PCR引物和TaqMan探針，進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。當(dāng)溶液中存在PCR產(chǎn)物時(shí)，該探針與模板退火，即產(chǎn)生了適合于核酸外切酶活性的底物，從而將探針5’-端連接的熒光分子從探針上切割下來，破壞兩熒光分子間的PRET，發(fā)出熒光。通常用于少量SNP位點(diǎn)分析。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司按公司利用的就是此方案。公司公眾號(hào)：上海翼和生物

LDR連接酶檢測(cè)法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn)，基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng)，分型結(jié)果準(zhǔn)確，可進(jìn)行多重反應(yīng)，性價(jià)比較高，且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測(cè)序法的單一位點(diǎn)檢測(cè)而言，LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時(shí)檢測(cè)，提高檢測(cè)通量，因此前期需要一定時(shí)間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案，連續(xù)樣本的分型需求，提高實(shí)驗(yàn)通量的同時(shí)降低分型單價(jià)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海，2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司SNP數(shù)量多，分布很普遍。

3.HRM法高分辨率熔解曲線分析（HRM）是近幾年興起的SNP研究工具，它通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的結(jié)合情況，來判斷是否存在SNP，而且不同SNP位點(diǎn)、是否是雜合子等都會(huì)影響熔解曲線的峰形，因此HRM分析能夠有效區(qū)分不同SNP位點(diǎn)與不同基因型。這種檢測(cè)方法不受突變堿基位點(diǎn)與類型的局限，無需序列特異性探針，在PCR結(jié)束后直接運(yùn)行高分辨率熔解，即可完成對(duì)樣品基因型的分析。該方法無需設(shè)計(jì)探針，操作簡(jiǎn)便、快速，成本低，結(jié)果準(zhǔn)確，并且實(shí)現(xiàn)了真正的閉管操作。主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大，主要方法是TaqMan探針法。無錫微衛(wèi)星STRSNP分型質(zhì)量好

目前在nature genetics和cell這樣的雜志，也不乏SNP的文章。上海微衛(wèi)星STRSNP分型準(zhǔn)確度高

連接酶檢測(cè)反應(yīng)(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別，高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法，對(duì)SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長(zhǎng)度差異的探針，當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對(duì)，所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行，沒有連接產(chǎn)物；相反，若探針與模板DNA完全互補(bǔ)，故進(jìn)行連接反應(yīng)，通過溫控循環(huán)，該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行，達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。，后通過熒光掃描片段長(zhǎng)度，實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測(cè)。上海微衛(wèi)星STRSNP分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求。公司自創(chuàng)立以來，投身于細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測(cè)，生物技術(shù)服務(wù)，是醫(yī)藥健康的主力軍。翼和生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路，既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng)，又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場(chǎng)需求，提高產(chǎn)品價(jià)值，是我們前行的力量。