單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每...
在一切由細胞身份開始說起一文中,小E已經為大家羅列出目前已經確定被Hela細胞污染的細胞系名稱。做細胞實驗的伙伴們可以翻閱一下,以防自己的細胞也在其中!還不僅只如此,這些常見的細胞系除了發現種屬內的交叉污染/錯誤鑒定,還有部分細胞系被發現連種屬都被錯誤鑒定了!...
有名的Hela細胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細胞。這位理應在生物學史上占據一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細胞已被培養了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的...
5.IlluminaBeadXpress法采用Illumina公司的BeadXpress系統進行批量SNP位點檢測,可以同時檢測1-384個SNP位點,往往用于基因組芯片結果確認,適合高通量檢測。微珠芯片具有高密度、高重復性、高靈敏度、低上樣量、定制靈活等特點...
SNP挑選:(1)SNP位于非編碼區;(2)SNP平均分布在29條常染色體上;(3),小等位基因頻度(MAF)需大于30%,保證位點有足夠多態性;SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP:59個SNP采用上海翼和應用生物技術有限公司的Hi-SNP技術,由本公司實施多重...
競爭性等位基因特異性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英國LGC(**化學家實驗室)公司所開發的技術,被比較常見用于少位點,多樣本的SNP分型中,與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的...
3.HRM法高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具,它通過實時監測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴增產物的結合情況,來判斷是否存在SNP,而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此HRM分析能夠有效區分不同SNP位...
這種熔解分析只能區分在片段大小和GC含量上差別較比較明顯的DNA序列,比如檢查PCR擴增產物中是否存在引物二聚體及其他非特異性的擴增。如果要區分SNP,分辨率還不夠。為什么呢?這里有必要先介紹一下飽和染料和非飽和染料。SYBRGreenI就屬于非飽和性染料,由...
在表觀遺傳中,DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環5號位的甲基化修飾,又稱作5-甲基胞嘧啶(5mC),是**常見的甲基化修飾方式,也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認為當DNA甲基化出現在基因啟動子區,就會抑制基因轉錄,從而起...
5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型,能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法,能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水...
表觀遺傳學研究已經證實了特定基因區域的DNA甲基化修飾對于染色體構象、基因表達調控機制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學為關注的內容之一。Bisulfite處理能夠將基因組中未發生甲基化的C堿基轉換成U,進行PCR擴增后變成T,與原本具有...
全基因組甲基化測序結合了亞硫酸氫鹽轉化(bisulfiteconversion)方法與新一代高通量測序技術,可在單堿基分辨率水平上高效地檢測全基因組DNA甲基化狀態。亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,...
DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase, DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應,在真核生物...
相信對研究遺傳學及相關方向的老濕和童鞋來說,SNP肯定是,不陌生的名詞,它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。大量存在的SNP位點,使人們有機會發現與各種疾病相關的基因組突變。小明:濕兄,濕兄!老濕讓我找SNP位點,要怎么找呀?濕兄:淡定!說清楚問題~小明:我的...
DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase, DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應,在真核生物...
上海翼和應用生物技術有限公司是一具有16年行業經驗的專業遺傳學服務供應商。公司的首席科學家為肖君華教授(東華大學生物科學與技術研究所教授;中國遺傳學會理事;上海市遺傳學會常務理事)。公司擁有兩大專業平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺...
片段長度多態性(限制性內切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴增目的片段DNA,擴增產物再用特異性內切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性...
SNP基因分型技術原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段,主要特點是準確性高、靈活性強、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質共結晶后在真空管中受瞬時納秒(...
SNP(單核苷酸多態性)是,新發展起來的第三代分子標記技術,具有分布廣,多態信息量大,易于檢測和統計分析等特點.目前,SNP技術在水稻,玉米,大豆等作物研究中應用較多.本文綜述該技術在這些作物的遺傳標記,分子標記輔助選擇,構建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜...
目前翼和業務領域涵蓋靶向捕獲二代測序、細胞系STR遺傳背景鑒定和SNP基因分型三大板塊。在基因檢測應用中,公司采用TaqMan、LDR與等位基因PCR技術,為客戶提供高性價比的服務。翼和**團隊將繼續秉承“專業、協作、進取”的企業精神,致力于應用遺傳學診斷技術...
有名的Hela細胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細胞。這位理應在生物學史上占據一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細胞已被培養了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的...
熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫大學新橋醫院內分泌科發表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translati...
現如今,大家在購買細胞株的時候,會面臨諸多突出的問題︰①細胞活性不足,收到細胞后存活率不高,導致實驗無法正常進行;②細胞本身的質量無法保證,除正規單位的細胞外,無法確認細胞源本身質量;③市場上以次充好、良莠不齊、魚龍混珠的假細胞比比皆是、無法分辨。如果你一不注...
在過去的的幾十年間,在細胞生物學領域,文章一直在發表,科研成果一直在公布,但是當中哺乳動物細胞被錯誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時存在著。2010年有雜志(IJC)統計出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細胞被Hela細胞污染的情況。當然還有,在200...
本文購自ATCC等機構的細胞(如SW480,HCT116, FET細胞系等),均全部由上海翼和應用生物技術有限公司鑒定。其中,HCT116細胞系,雖源于一個男性個體,但其現存細胞系在世界上有兩種性別,翼和公司以自己的專業對其成功的進行了鑒定。文章認為,盡管AB...
主要是指同源蛋白質的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市...
異源同源基因(xenologousgene)是由于基因在不同物種間的橫向轉移(horizontaltransfer)而產生的。異源同源基因在原核生物中研究比較多。**近研究表明,異源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementins...
TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應體系中加入2種不同熒光標記的探針,它們可以分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有...
SNP 全稱 Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括 轉換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標記,其數量很多,多態性豐富,有些 SNP 位點直接影響基因功 能,從而導致生物性狀改變。SN...
多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農作物和動物都是多倍體,例如:小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復雜,給遺傳學研究帶來了很大挑戰。在SNP分型、目標區間重測序和分子克隆等過程中,特異性擴增...