單細胞測序結果動輒上百G數據量,龐大的數據對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數據的質控環節:單細胞測序產生數億的結果序列,不可避免的會出現低質量的測序結果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量...
所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(...
基于10XGeomics動態微流控技術,利用Tn5轉座酶酶切開放染色質,形成短片段,單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,揭示單細胞染色質的可及性問題,區分細胞異質性,獲得開放染色質的位置、轉錄因子的結合位點、核小體的調控區域和染色質狀態等信息,是單細胞表觀...
您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BDRhapsody單細胞捕獲系統,BDRhapsodyTM單細胞捕獲系統采用微孔技術,對細胞的捕獲沒有偏好性,實現高達80%的微孔板捕獲率,由于單個微孔板中容納了22萬+個微孔,而現階段單細胞測序實驗技術通常要求單個樣本捕...
BDRhapsody單細胞轉錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,針對多種組織類型的樣本,采用BD細胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序...
作為單細胞測序的又一個重要里程碑,BDRhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎信息學軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析...
空間轉錄組測序的關鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區域,每個捕獲區域中錨定...
烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細胞懸液:可使用碧迪醫療單細胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯抗體( Ab-Oligos)將細胞染色 2.微孔板預充和處理:使用自動移液器進行液體交換 3...
10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barc...
為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題,針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,烈冰依托自主研發的NovelBrain?生物大數據分析平臺,為用戶...
高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆...
在發育過程或疾病發生過程中,組織內部的不同細胞經歷了復雜的生物學過程,因此,組織內部的異質性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內部的異質性包括細胞類型的異質性和空間位置的異質性兩個層面,細胞類型異質性可由單細胞測序來完美呈現,而空間位置的異質...
烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱...
空間轉錄組測序的數據質量和玻片有效區域的利用率、貼片的質量和透化時間息息相關。貼片質量不良會影響總的有效spot數等;而透化不合理會導致spot的reads數、基因中位數等參數。而在特異性基因表達方面,我們也可以統計空間轉錄組群體的特異性基因表達即Marker...
BDRhapsody單細胞分選系統集成了熒光顯微成像系統,可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數。在進行質量評估之前,首先要將細胞的培養體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中,需要進行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉...
從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數據集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫...
為什么需要單細胞分辨率?生物學就像宇宙一樣。它非常復雜,有許多獨特的單體,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構建并驅動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發現和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異...
當蜂巢孔內同時落入細胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入細胞裂解液對細胞進行裂解,使細胞內的RNA與磁珠上的標簽進行結合,完成每個細胞內RNA的捕獲和標記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進行回收,待所有質控結果確認通過后就可以進行后續的RNA反...
單細胞測序結果動輒上百G數據量,龐大的數據對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數據的質控環節:單細胞測序產生數億的結果序列,不可避免的會出現低質量的測序結果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量...
烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據豐富的實戰經驗為用戶量身打造了一款單細胞測...
分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集中于探究單細胞內表觀遺傳組各層面的變化及關聯。功能研究型單細胞多組學測序技術,結合了強大的CRISPR基因編輯技術,從而可以深度挖掘基因表達調控與細胞功能以及命運決定之間的因果關系。在未來,為了更系統地研究多層組學之間...
單細胞測序技術(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質性、樣本微環境、發育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數據解析,解決了BulkPopulationSequencing所無...
對于單細胞測序而言,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續各項分析,并且數據分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,特...
BDRhapsody單細胞分選系統集成了熒光顯微成像系統,可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數。在進行質量評估之前,首先要將細胞的培養體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中,需要進行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉...
烈冰科技作為國內同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰總結搭建出不同的數據...
轉錄組學和蛋白質組學都是獲得基因表達情況的重要工具,從生物學角度上看,轉錄組表示了基因表達的中間狀態,可以反映諸如轉錄調控、轉錄后調控的機理;而蛋白質是生物體直接的功能執行者,因而對其表達水平的研究有著不可替代的優勢。要探究生物體疾病機理、脅迫機制,精確研究重...
對于單細胞測序而言,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續各項分析,并且數據分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,特...
隨著單細胞轉錄組測序技術(scRNA-Seq)的蓬勃發展,其在在胚胎發育,腫瘤細胞異質性,免疫細胞轉化等多方面屢建奇功,但是由于細胞形態的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數據分析時可能會出現細胞類型占比失真,個別細胞類型丟失等...
2016年發表的DR-seq和G&T-seq技術,實現在單細胞內同時進行基因組和轉錄組的測序分析,使得研究人員能夠在分析細胞間基因組差異和基因表達異質性的同時,進一步理解基因組序列差異、拷貝數變異與轉錄組異質性之間的關系.隨后在同一個單細胞內,基于轉錄組、染色...