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基于10XGeomics動態微流控技術，利用Tn5轉座酶酶切開放染色質，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上，揭示單細胞染色質的可及性問題，區分細胞異質性，獲得開放染色質的位置、轉錄因子的結合位點、核小體的調控區域和染色質狀態等信息，是單細胞表觀...

對于單細胞測序而言，常常需要先構建細胞圖譜，在此基礎上再開展后續各項分析，并且數據分析時以細胞聚類（cellcluster）為討論對象，而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別...

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數據，能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入genelist構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱...

為什么需要單細胞分辨率？生物學就像宇宙一樣。它非常復雜，有許多獨特的單體，也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構建并驅動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發現和定義這些細胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學復雜性的基因表達異...

10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域，每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcodedspots），每個點的直徑為55μm，點和點之間中心的距離為100μm，并且每個點都有一個barc...

烈冰科技作為國內同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經過多年實戰，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗，實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰總結搭建出不同的數據...

空間轉錄組測序與單細胞測序的結果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質量就成為了制約空間轉錄組有效...

烈冰提供空間轉錄組全流程服務，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續的FISH驗證等各個步驟，為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數字掃描儀為基...

空間轉錄組測序的關鍵就在于，解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后，會被進行透化處理，釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區域，每個捕獲區域中錨定...

在轉錄組學領域，空間轉錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉錄組學評價為2020年度方法，空間轉錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉錄組測序到實現單細胞轉錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類...

烈冰科技作為國內率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經過多年實戰，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗，實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰總結搭建出...

科技的發展讓單細胞測序已經應用于疾病發展過程中的關鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉化、惡性向轉移性的發展，以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得...

高通量測序技術（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測序技術（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆...

針對單細胞測序的細胞上樣數，為什么不建議捕獲到的細胞數量越高越好？一味地追求高數量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時，如果目標細胞捕獲數增加到8000甚至10000，上樣細胞懸液體積勢必增加，在細胞懸液質量不是很理想（細胞活性5%、結團...

烈冰科技專注為科研學者提供專注的測序數據分析服務，先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細胞測序進入發展的快車道，烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司，依托自主研發的NovelBrain...

烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據，深度解讀數據分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據豐富的實戰經驗為用戶量身打造了一款單細胞測...

二代測序技術在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencingbysynthesis）和大規模平行測序技術（massiveparallelanalysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如IlluminaSolexa測序...

截至2022年6月，烈冰生物助力發表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發展，靶點探索，免疫研究，神經發育，干細胞分化，植物發育，退行病變，糖尿病，COVI...

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數大約在50k左右；每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數量較多的組織中，由于該類型細胞表達...

截至2022年6月，烈冰生物助力發表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發展，靶點探索，免疫研究，神經發育，干細胞分化，植物發育，退行病變，糖尿病，COVI...

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞轉錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構，無法給出固...

截至2022年6月，烈冰生物助力發表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發展，靶點探索，免疫研究，神經發育，干細胞分化，植物發育，退行病變，糖尿病，COVI...

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態，在異質性發育過程中具有特殊的應用價值。然而，單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細...

單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？烈冰2000+項目消化經驗，100+組織類型解離protocol，精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉錄組的變化，在對細胞進行清洗和計數后，單細胞懸液應當保存于冰上，直至用于后續的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應當在3min鐘內將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細胞的不同性質，因為這可能會影響細胞應...

10×Genomics單細胞方案要求使用具有較高活性的單細胞懸液。在實際實驗中，我們發現因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同，容易出現單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物對獲得高質量數據是至關重要的。這是因為，死亡的細胞...

多樣本數據合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大，需要進行Downsample處理，以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測...

單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽，需要對細胞數量、細胞活性進準判斷，這對SingleCell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高，將會影響建庫的成功率；計數偏低，則會提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數據的利用率大打...

為什么需要單細胞分辨率？生物學就像宇宙一樣。它非常復雜，有許多獨特的單體，也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構建并驅動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發現和定義這些細胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學復雜性的基因表達異...

單細胞多組學提升見解基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處，因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息，那么單細胞多組學提供了同一細節的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10xGenomics...