所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。空間轉錄組測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴...
所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。空間轉錄組測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴...
空間轉錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態學結論,通過觀察基因表達區域,了解可能發生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結構-功能關系,正常vs.疾病大腦結構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層; 在發育生物學,通過解析每個發育階段不同解剖區域特有的基因表達特征,解析組織中與形態形成相關基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創建組織發育的空間細胞圖譜。全線搭建10x Genomics空間轉錄組測序平臺。無錫烈冰科技空間轉錄組測...
烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。高通量測序技術是對傳統測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬...
已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“...
在發育過程或疾病發生過程中,組織內部的不同細胞經歷了復雜的生物學過程,因此,組織內部的異質性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內部的異質性包括細胞類型的異質性和空間位置的異質性兩個層面,細胞類型異質性可由單細胞測序來完美呈現,而空間位置的異質性,則需要可高通量地檢測全轉錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發表。烈冰開展了空間轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。深圳BD Rhapsody空間轉錄組技術支持10XGenomics...
解決空間轉錄組測序數據分析中由于超大數據量、超高的質控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉錄組分析;擁有行業先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數字切片掃描儀,可以同時實現明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。空間轉錄組測序技術提供了空間轉錄組水平下的科學研究視角。北京BD空間轉錄組測序服務公司...
RNA測序(RNA-seq)是轉錄組學研究的重要工具,也是生命科學領域常用的技術之一。相比于傳統通路研究低維度、低通量的局限性,轉錄組學有以下優勢:1)能夠動態考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結構以及在細胞生命活動中的重要調控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現細胞水平的變化信息。作為轉錄組學研究的技術基礎,RNA測序技術也在不斷地更新迭代,現如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。重慶scRNA空間轉錄組測序10XVisiu...
轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的分析。轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進行親和純化的RNA聚合酶II轉錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統的芯片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化信號,是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。FFPE空間轉錄組技術原理 為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況,揭示精細病理區...
空間組測序技術,作為現階段單細胞技術的重要補充技術進入了組學的實驗領域以及生物信息學的分析領域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉錄組測序(空間表達尺度)+數字病理(臨床診斷尺度)聯合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態系統,多角度深入分析組織的形態特征、基因組學特征、表觀遺傳調控因子以及樣本中的免疫微環境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉錄組分析實際上是非常需要研究者和企業之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉錄組測序結果的系統也是空轉分析中不可或缺的一環,也是重中之重。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規模發現和復雜疾病研究的測序。...
烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發表;專業實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業的生物學團隊提供個性化的產品應用場景解讀、保持對生物學意義的關注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環境經驗豐富的實驗團隊,為獲得示組織內真實表達水平的高質量冷凍切片提...
烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據豐富的實戰經驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結果文件可視化,還可以實現分析結果的三維立體化的展示呈現。專業的生信代碼交給專業的烈冰,專業的生物學意義交給專業的您!高通量測序技術是對傳統測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。上海BD Rhapsody空間轉錄組測序...
細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞測序結果動輒上百G數據量,龐大的數據對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,單細胞轉錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構,無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。武漢上海烈冰生物空間轉錄組服務機構空間轉錄組測序的數據質量和玻片有效區域的利用率、貼片的質量和透...
在轉錄組學領域,空間轉錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉錄組學評價為2020年度方法,空間轉錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉錄組測序到實現單細胞轉錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助。現在,新的空間轉錄組方法不僅帶來轉錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。烈冰科技成立10余年,為科研學者提供專注的測序數據分析服務。重慶高通量測序空間轉錄組技術支持空間轉錄組測序的數據分析基本分為三個階段:1.數據的預處理部分;...
烈冰科技作為國內同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰總結搭建出不同的數據預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫療健康等領域對大數據分析的需求。完備的高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等,配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。...
高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業生物背景和十二年科研服務經驗,已...
生命科學研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息,不僅可以推斷出相應未知基因的功能,揭示特定調節基因的作用機制,而且可以辨別細胞的類型和異質性,為疾病診斷提供理論依據。但由于研究的深入或具體研究方向和內容的不同,傳統的轉錄組測序技術顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心,更加直觀地反映組織中基因的表達情況,隨即單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空間轉錄組(Spatial transcriptomics,ST)測序等一系列技術應運而生。烈冰空間轉錄組測序助您深...
單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環境,將成為發育生物學、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器。十二年測序經驗,累計服務與5000余項重要科研項目。廈門BD空間轉錄組平臺空間轉錄組數據可以用單細胞轉錄組數據的分析策略進...
當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,通過透化處理,細胞內的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉錄組的重點在于芯片部分:正式文庫構建的芯片上有4個捕獲區域(6.5mmX6.5mm,可以檢測4個樣本)每個捕獲區域含有約5000個被條形碼標記的點(barcodedspots)每個spot直徑55μm,每個spot能捕獲1-10個細胞spot與spot中...
10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。深圳scRNA空間轉錄組多組學測序烈冰生物真正實現空間轉錄組測序...
基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環只上一個dNTP。每一輪循環結束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環數的增大會出現不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。空間轉錄組測序,上海烈冰生物科技很靠譜。武漢上海烈冰生物空間轉錄組測序服務10xGenomic...
烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據豐富的實戰經驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結果文件可視化,還可以實現分析結果的三維立體化的展示呈現。專業的生信代碼交給專業的烈冰,專業的生物學意義交給專業的您!烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。西安scRNA空間轉錄組測序其實,空間轉錄組的概念早就已經存在了...
空間轉錄組測序的關鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區域,每個捕獲區域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區域對應的組織位置會被記錄下來,然后再進行測序后,通過條形碼將不同區域的測序結果,映射到對應的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉錄組圖像。全線搭建10x Genomics空間轉錄組測序平臺。武漢BD空間轉錄組數據分析可視化烈冰提供空間轉錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透...
10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。烈冰科技空間轉錄組多組學測序為同時獲得空間表達...
10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。烈冰開展了空間轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。溫州高通量測序空間轉錄組測...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,烈冰依托自主研發的NovelBrain?生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的空間轉錄組測序服務和解決方案。烈冰經過十幾年的經歷,已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。國產化PanoCell空間轉錄組測序平臺,提供高性價比服務方案。武漢烈冰生物空間轉錄組服務機...
在發育過程或疾病發生過程中,組織內部的不同細胞經歷了復雜的生物學過程,因此,組織內部的異質性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內部的異質性包括細胞類型的異質性和空間位置的異質性兩個層面,細胞類型異質性可由單細胞測序來完美呈現,而空間位置的異質性,則需要可高通量地檢測全轉錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發表。空間轉錄組測序機構,請認準上海烈冰生物科技。杭州scRNA空間轉錄組服務機構細胞在組織樣本中的相對空間位置關系對于了解疾病病理學非常重要。但是scR...
烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動...
所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。空間轉錄組測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴...
轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的分析。轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進行親和純化的RNA聚合酶II轉錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統的芯片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化信號,是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。FFPE空間轉錄組技術原理 為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。高通量測序技術是對傳統測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百...