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空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程：1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時(shí)間不盡相同，在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?yàn)前，需要利用組織優(yōu)化kit進(jìn)行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)區(qū)域均覆蓋了熒光標(biāo)記探針，可捕獲mRNA形成帶有熒光標(biāo)簽的cDNA，隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時(shí)間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后，即可進(jìn)行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程。空間轉(zhuǎn)錄組測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。南京上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難，做...

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中，組織內(nèi)部的不同細(xì)胞經(jīng)歷了復(fù)雜的生物學(xué)過程，因此，組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學(xué)研究的一個(gè)重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細(xì)胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個(gè)層面，細(xì)胞類型異質(zhì)性可由單細(xì)胞測序來完美呈現(xiàn)，而空間位置的異質(zhì)性，則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控，做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、空間信息標(biāo)記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù)，助力高分文章發(fā)表。空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析，認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。無錫烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司細(xì)胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾...

RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢：1）能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá)，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充，多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司烈冰提供空間轉(zhuǎn)...

解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難，做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析；擁有行業(yè)先進(jìn)的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀，可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像；Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴(kuò)展多層融合掃描模式，進(jìn)一步提升分辨率和清晰度，保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細(xì)采集；能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗(yàn)證以及組織切片的免疫組化的高清成像，獲取表達(dá)與定位信息。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀(jì)元。廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商...

細(xì)胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學(xué)非常重要。但是scRNA-Seq在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題，通過記錄組織切片細(xì)胞的空間信息，捕獲組織切片中的組織學(xué)信息；通過免疫熒光進(jìn)行蛋白組檢測，將基因表達(dá)譜映射回組織樣本中的原始位置，同時(shí)獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué)，發(fā)育生物學(xué)，免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達(dá)情況的新視角。十二年測序經(jīng)驗(yàn)，累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）...

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中，通過添加基因表達(dá)維度，得出形態(tài)學(xué)結(jié)論，通過觀察基因表達(dá)區(qū)域，了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué)，研究免疫細(xì)胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征；免疫群體擴(kuò)散、不同類型免疫細(xì)胞的空間位置解析； 在神經(jīng)科學(xué)，研究大腦皮層層狀組織解析，揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系，正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層； 在發(fā)育生物學(xué)，通過解析每個(gè)發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征，解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因；豐富基因表達(dá)的空間注釋信息，創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。合肥烈冰生物空...

RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢：1）能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá)，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充，多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。空間轉(zhuǎn)錄組測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系，一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。合肥空...

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添...

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcodedspots），每個(gè)點(diǎn)的直徑為55μm，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100μm，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列，然后進(jìn)行文庫構(gòu)建并進(jìn)行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個(gè)位置，從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。成都烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序作...

10XVisium的實(shí)驗(yàn)主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息；組學(xué)板塊包括cDNA的合成、擴(kuò)增、接頭連接和測序，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息。具體實(shí)驗(yàn)流程如下：A、切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍、切片，并進(jìn)行HE染色成像，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，并進(jìn)行固定和透化，使細(xì)胞中的mRNA得到釋放，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上，從而獲取基因表達(dá)信息。C、逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建：以捕獲的RNA為模板，進(jìn)行cDNA合成，和測序文庫制備。D、高通量上機(jī)測序：對制備...

生命科學(xué)研究的目的之一就是為了解決細(xì)胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術(shù)可提供特定條件下某些 組織中基因的表達(dá)信息，不僅可以推斷出相應(yīng)未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機(jī)制，而且可以辨別細(xì)胞的類型和異質(zhì)性，為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同，傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)顯然不能夠滿足科研工作者們強(qiáng)烈的好奇心，更加直觀地反映組織中基因的表達(dá)情況，隨即單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial transcriptomics，ST）測序等一系列技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。烈冰生物成立于2010年...

相比于常規(guī)的測序手段，空間轉(zhuǎn)錄組測序有幾個(gè)明顯的優(yōu)勢：1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對應(yīng)，體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性：每個(gè)區(qū)域獨(dú)特的條形碼使測序結(jié)果與空間位置形成一一對應(yīng)關(guān)系。雖然暫時(shí)還無法精細(xì)到單細(xì)胞層面，但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對全組織進(jìn)行分析：芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個(gè)反應(yīng)中完成測序，能有效降低多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)中的誤差。測序結(jié)果如果不按照條形碼歸類，則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況，無需再做單獨(dú)檢測。3.為進(jìn)一步的研究提供指導(dǎo)意見：常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測序，對后續(xù)實(shí)驗(yàn)的指導(dǎo)仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測序則可以標(biāo)識(shí)出更有價(jià)值的研究區(qū)域，引導(dǎo)研究者...

烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機(jī)，搭配切片經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)，可以提供一致性更高、實(shí)驗(yàn)操作更精細(xì)的冷凍切片準(zhǔn)備方案，保持密切高效的溝通，設(shè)計(jì)更適合的實(shí)驗(yàn)方案，確保每一個(gè)實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)有效進(jìn)行；烈冰升級(jí)配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng)，更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息，10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇，為不同大小的樣本提供更清晰的圖像，更精細(xì)的圖像信息采集、拼接策略，為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學(xué)提供更清晰的影像；烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù)。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小...

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù)，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗(yàn)證等各個(gè)步驟，為您提供無憂服務(wù)。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機(jī)、尼康多熒光通路全自動(dòng)掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，并制定嚴(yán)格規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP，經(jīng)過大量的切片、貼片實(shí)操演練，對不同類型組織的切片厚度、溫度進(jìn)行優(yōu)化，確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺(tái)，搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程，準(zhǔn)確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析，...

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù)，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗(yàn)證等各個(gè)步驟，為您提供無憂服務(wù)。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機(jī)、尼康多熒光通路全自動(dòng)掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，并制定嚴(yán)格規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP，經(jīng)過大量的切片、貼片實(shí)操演練，對不同類型組織的切片厚度、溫度進(jìn)行優(yōu)化，確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺(tái)，搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程，準(zhǔn)確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析，...

在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域，空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評(píng)價(jià)為2020年度方法，空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進(jìn)入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測序，這一過程為精確認(rèn)識(shí)不同細(xì)胞類型提供了巨大的幫助。現(xiàn)在，新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息，同時(shí)還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置，進(jìn)一步擴(kuò)展到單細(xì)胞分辨率，這會(huì)更大程度提升科學(xué)家對單個(gè)細(xì)胞的認(rèn)識(shí)和解讀。空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。廈門高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)空間轉(zhuǎn)錄組測序的關(guān)鍵就在于，解決了空間位置保留的問題。被放置在芯...

10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道，從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到油相孔道中。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴后輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫，進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過程。測序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記（SN...

單細(xì)胞測序是指針對單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而，單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。濟(jì)南烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義；3.Spot分...

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細(xì)胞測序的結(jié)果不同，這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候，貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上，那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達(dá)，即無有效Spot位點(diǎn)。同樣的，另一個(gè)就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。空間轉(zhuǎn)錄組測序機(jī)構(gòu)，請認(rèn)準(zhǔn)上海烈冰生物科技。成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄...

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時(shí)間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會(huì)影響總的有效spot數(shù)等；而透化不合理會(huì)導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達(dá)方面，我們也可以統(tǒng)計(jì)空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene，將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對于任意一個(gè)已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細(xì)胞Marker，然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解，群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。烈冰引進(jìn)國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺(tái)，提供保留組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測序。上海高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視...

空間組測序技術(shù)，作為現(xiàn)階段單細(xì)胞技術(shù)的重要補(bǔ)充技術(shù)進(jìn)入了組學(xué)的實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過單細(xì)胞測序（單細(xì)胞表達(dá)尺度）+空間轉(zhuǎn)錄組測序（空間表達(dá)尺度）+數(shù)字病理（臨床診斷尺度）聯(lián)合分析可在空間和時(shí)間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng)，多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細(xì)胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式，空間轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動(dòng)的，尤其是對于組織切片的理解，一個(gè)在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán)，也是重中之重。空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學(xué)研究視角。廣州...

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程：1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時(shí)間不盡相同，在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?yàn)前，需要利用組織優(yōu)化kit進(jìn)行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)區(qū)域均覆蓋了熒光標(biāo)記探針，可捕獲mRNA形成帶有熒光標(biāo)簽的cDNA，隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時(shí)間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后，即可進(jìn)行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程。十二年測序經(jīng)驗(yàn)，累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liv...

10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道，從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到油相孔道中。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴后輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫，進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過程。助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力生命健康醫(yī)療...

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcodedspots），每個(gè)點(diǎn)的直徑為55μm，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100μm，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列，然后進(jìn)行文庫構(gòu)建并進(jìn)行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個(gè)位置，從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。附加流式分選細(xì)胞表面Marker，對于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測序項(xiàng)目。重慶烈冰科技空間轉(zhuǎn)...

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向：1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性：對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細(xì)胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2．建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個(gè)人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細(xì)胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍(lán)區(qū)胚胎發(fā)育的動(dòng)態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的，空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍(lán)圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外，其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測試完畢的組織類型有：人：心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠：大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢，四頭肌、小腸、脾勝、胃、...

10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道，從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到油相孔道中。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴后輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫，進(jìn)而完成細(xì)胞中RNA的捕獲過程。烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助您深入探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征...

單細(xì)胞測序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進(jìn)行高通量測序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評(píng)選的科學(xué)突破。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)...

所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測對應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克隆），成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對接渠道，幫助您快速定位項(xiàng)目訴...

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度。測序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán)，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團(tuán)封閉，保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí)，會(huì)通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán)，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點(diǎn)的熒光，實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會(huì)出現(xiàn)不同步的情況，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。深度的空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時(shí)代。無錫BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析...

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學(xué)背景整合，使基因表達(dá)譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案，該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)信息的壁壘，能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達(dá)信息，在形態(tài)學(xué)背景下實(shí)現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)，進(jìn)一步擴(kuò)展空間生物學(xué)的可能性。烈冰生物成立于2010年，專注于空間轉(zhuǎn)錄組測序領(lǐng)域科研服務(wù)。濟(jì)南烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)單細(xì)胞測序是指針對單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可...