尿液代謝組學研究案例,空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析,其中GC-MS檢測102種代謝物,LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節性,結果表明性別和季節對本研究的結果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明,Pu1和Po1之間的差異代謝物數量大于Po1和C之間的差異,LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物,體現出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物,使用綜合分析獲得候選差異代謝物,其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物,確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物,包括8種脂質、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明,***富集到5種代謝通路,與免疫、炎癥、人類的環境壓力、缺血和缺氧有關。代謝組學——尋找代謝物與生理病理變化的相對關系研究方式。浙江代謝組學血清
代謝組學研究:濃香白酒占中國白酒總產量的70%以上。自1960年代以來,在中國白酒釀造行業中,人工窖泥被***用于建造發酵窖以生產高質量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學機制,以及這種變化與生產高質量濃香白酒之間的聯系,本文對該釀造微生態系統進行了***進行了16S rRNA測序,蛋白質組學和代謝組學聯合分析。多組學方法能夠更***地了解高質量濃香白酒生產過程中人工窖泥微生物群落發生的代謝過程變化,這將有助于進一步優化人工窖泥培養技術和改善濃香白酒的質量。上海定量 代謝組學代謝組學數據分析教程 代謝組學一般測幾個樣。
非靶代謝組學研究:2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫科大學附屬第二醫院消化內科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通過采用非靶代謝組學和基因表達芯片,發現了適應酸性微環境的胰腺導管腺* (PDAC)細胞具有更強的轉移和增殖能力。
代謝組學顯示適應酸性微環境的 PDAC 細胞中葡萄糖增加、糖酵解減少,而轉錄組學發現適應酸性微環境細胞中的差異表達基因主要為細胞外基質修飾和 Hippo 信號傳導相關基因。MMP1 在在適應酸性微環境細胞中上調**為明顯,實驗驗證了其由 YAP/TAZ 通路介導,而被 AMPK抑制。該研究確認了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進適應酸性微環境的 PDAC 細胞的增殖和轉移。
代謝組學經典研究:本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學的經典研究,***篇文章運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學探究番茄果實成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運用16S rRNA測序+代謝組學技術研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環境的機制。第三篇文章運用GC-MS頂空代謝組學探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發現了幾種不同的揮發性化合物。第四篇文章運用GC-MS非靶向代謝組學技術對對全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進行了研究。常用的代謝組學相關數據庫有人類代謝組數據庫KEGG數據庫、Reactome數據庫。
本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。上海 -代謝組學-提供高效檢測分析服務。上海定量 代謝組學
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LC-MS非靶向代謝組學,中文標題:TNT、RDX、HMX(三種物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性機制分析研究對象:苜蓿根發表期刊:Chemosphere影響因子:7.086發表時間:2021.05.18合作單位:西南科技大學運用關鍵技術:LC-MS非靶向代謝組學文章中LC-MS非靶向代謝組學由歐易/鹿明生物提供技術支持2021年5月,西南科技大學羅學剛教授團隊在Chemosphere期刊發表的研究成果,通過LC-MS非靶向代謝組學研究方法,探索了物暴露對植物的毒性機制,驗證了植物體內被降解的TNT、RDX和HMX殘留物和中間產物干擾植物正常生理代謝的假設。描繪了在三種物影響下苜蓿代謝組圖譜,為環境污染物毒理學研究提供了新思路和方法。浙江代謝組學血清
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