空間代謝組學:在大鼠腦繪制特定區域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度,通過人類代謝組數據庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經遞質等。***系統(CNS)的特定功能和特定解剖區域相關。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達;γ-氨基丁酸是一種抑制性神經遞質,其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。空間代謝組相關技術服務,經驗豐富。福建空間代謝組學技術怎么應用
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發現MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發現MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發現與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調節FA合成基因的表達,還調節糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調節參與脂質合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發現,增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。福建空間代謝組學技術怎么應用空間代謝組技術流程 。
空間代謝組學:前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標志物、驗證臨床生物標志物和確定潛在的***靶點非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質和**區域,具有高度異質性,組織間固有的功能和分子差異導致常規的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質譜成像(MSI)可以對組織切片不同區域中的潛在**標志物進行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質組學特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數據庫。
獲取空間代謝組學圖像。計算了負離子和正離子模式下的平均空間代謝質譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(紅色)或非注射側(綠色)的后驗概率。該分析基本證實了拉曼光譜特征,與對側正常側(非注射側)相比,再髓鞘損傷(注射側)發生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯質譜法確認了區分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區域的*****峰,并在表1中報告。拉曼光譜和空間代謝組學表明,再髓鞘化區域的脂質成分不同于原始髓鞘的脂質成分。從小鼠模型獲得的結果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對脂質成分差異的***個直接指標。空間代謝組性價比高.擁有專業技術團隊。
進行了相關的空間代謝組學研究來自同一患者的正常白質組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關的特定脂質譜(圖6D?1)。通過串聯質譜法確認鑒定的脂質,并在表2中報告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區域主要在PC和PE脂質群的組成上不同。結果表明,HSL成像可以有效地用于多發性硬化患者死后病變的脂質譜分析,并表明多發性硬化患者再髓鞘化過程中產生的髓鞘與附近正常出現的白質相比具有改變的脂質譜。(a)正常白質(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標準差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結構水平顯示再髓鞘過程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗概率圖像突出NAWM(綠色)和有髓組織(紅色)。蛋白質組學的研究方法。安徽空間代謝組學公司
空間代謝組得到了廣大醫學領域科研工作者的信任。福建空間代謝組學技術怎么應用
空間代謝組學(AFADESI-MSI):中文標題:使用敞開式質譜成像技術及代謝組學繪制大鼠腦代謝網絡圖研究對象:大鼠腦發表期刊:AnalyticalChemistry影響因子:6.986發表時間:2021年4月23日研究單位:中國醫學科學院藥物研究所天然藥物活性物質與功能國家重點實驗室運用生物技術:空間代謝組學(AFADESI-MSI)。大腦是結構**復雜的***之一,主要功能與其微區的分子相互作用密切相關。大腦的小分子調節機制對理解***功能、精神疾病機理和藥物研發有很大的幫助。動物的認知過程和行為控制均依賴于腦部強大的***網絡——神經連接體。科學家進行了很多研究,但是對腦部小分子網絡的研究仍有不足。福建空間代謝組學技術怎么應用
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