2021年9月30日,國家自然科學基金委員會發布的《關于發布生命科學部2021年度指南引導類原創探索計劃項目指南的通告》中,也表達了對于空間多維組學的資助支持。2021年11月推出的“鹿明空間代謝組千萬醫學支持計劃(***期)”獲得了許多科研工作者的關注及參與。現正式推出“鹿明空間代謝組千萬醫學支持計劃(第二期)”。本次“鹿明空間代謝組千萬醫學支持計劃(第二期)”采用的AFADESI空間代謝組平臺,是基于中國醫學科學院藥物研究所再帕爾?阿不力孜教授與賀玖明教授團隊經過十年精心打磨,自主研發成功的AFAI-MSI儀器平臺。鹿明生物空間代謝組學。遼寧空間代謝組學 肝炎
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸到高分辨率質量分析儀進行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點的一個代表性質譜圖,在該圖中可以觀察到數千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區域具有特定分布。這些異質代謝分布與大鼠腦的功能和結構復雜性高度一致。實驗結果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質量比較大差異為0.001Da,同一物質的檢測動態范圍高達1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強度范圍從0到104甚至到106。福建空間代謝組學的質譜成像空間代謝組學二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學樣品信息的認知。
通過空間代謝組學檢測到正常腎臟與MYC誘導的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發現兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。酰基側鏈較短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現增加趨勢,然后開始減少,但酰基側鏈較長的PG含量持續增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實驗證明,MYC的誘導和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達豐度(圖6D)。結果顯示,MYC參與調節FA生成和相關基因的表達。
空間代謝組學:前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標志物、驗證臨床生物標志物和確定潛在的***靶點非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質和**區域,具有高度異質性,組織間固有的功能和分子差異導致常規的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質譜成像(MSI)可以對組織切片不同區域中的潛在**標志物進行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質組學特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數據庫。空間代謝組技術原理 。
鹿明生物空間代謝組學項目實測結果1、可實現代謝物定性數量:1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質,小分子物質檢測不被基質抑制,定性物質約70%為700Da以下的小分子物質,30%為脂質大分子。空間多組學聯合:空間代謝+空間轉錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉錄組(歐易生物)兩個平臺,已執行空間代謝+空間轉錄聯合項目10+。空間多組學檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統,分別連接QE或者QE-HF高分辨質譜儀。***套AFADESI成像系統(連接Thermo QE高分辨質譜儀)第二套AFADESI成像系統系統(連接Thermo QE-HF高分辨質譜儀)空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態范圍寬。海南空間代謝組學英文
歐易生物空間代謝組學適合整體方案,助力科研,。遼寧空間代謝組學 肝炎
1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質量數范圍50-500Da,質譜分辨率70,000。3.數據處理和代謝網絡分析原始數據經過轉化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結果;在獲取差異代謝物的高分辨率質譜信息后,使用Metaboanalys在線數據挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網絡信息。大腦中復雜網絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。遼寧空間代謝組學 肝炎
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