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廣西3d空間代謝組學

來源: 發布時間:2023-04-05

1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質量數范圍50-500Da,質譜分辨率70,000。3.數據處理和代謝網絡分析原始數據經過轉化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結果;在獲取差異代謝物的高分辨率質譜信息后,使用Metaboanalys在線數據挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網絡信息。大腦中復雜網絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。空間代謝組技術特點。廣西3d空間代謝組學

結果表明,原*基因MYC與SERBP蛋白共同調節**生長所必需的脂肪生成,MYC誘導SREBP1,然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促進脂肪鏈的延伸。小鹿推薦通過空間代謝組學技術,能夠觀察到MYC誘導后不同**的體內脂質組學變化,準確地繪制MYC特異性脂質代謝的位置,因此可以利用這一**的致命弱點,用于新的抗脂質藥物研究開發。在獲得空間代謝組學AFADESI平臺原創團隊全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經完成共計近千例樣本經驗,包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學檢測及分析,檢測物質涵蓋膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質類等多種類代謝物。上海質譜成像空間代謝組學空間代謝組三個維度的分析。

進行了相關的空間代謝組學研究來自同一患者的正常白質組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關的特定脂質譜(圖6D?1)。通過串聯質譜法確認鑒定的脂質,并在表2中報告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區域主要在PC和PE脂質群的組成上不同。結果表明,HSL成像可以有效地用于多發性硬化患者死后病變的脂質譜分析,并表明多發性硬化患者再髓鞘化過程中產生的髓鞘與附近正常出現的白質相比具有改變的脂質譜。(a)正常白質(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標準差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結構水平顯示再髓鞘過程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗概率圖像突出NAWM(綠色)和有髓組織(紅色)。

空間代謝組學:在大鼠腦繪制特定區域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度,通過人類代謝組數據庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經遞質等。***系統(CNS)的特定功能和特定解剖區域相關。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達;γ-氨基丁酸是一種抑制性神經遞質,其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態范圍寬。

空間代謝組的成像。生成空間代謝組譜圖和拉曼相關圖,從而能夠將振動光譜檢測到的結構特征分配給通過質譜檢測到的單個分子物種(圖3D,E)。一般說來,數據顯示了與多種不同脂質相關的拉曼振動峰之間的高度相關性。由于可以獲得很好的相關性,作者隨后對拉曼光譜和質譜進行了PLS多元回歸。用作為例子,作者回歸了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光譜。回歸載體顯示高度特異的脂峰,表明對磷脂酰膽堿具有特異性(圖3F)。回歸分析表明,可建立高度線性關系(校正R2=0.825)(圖3G)。假設在一級近似下質譜與濃度的線性關系,這個基于拉曼的模型可以作為復雜組織中特定脂質種類的預測因子。這些結果**了使用基于結構和生物分子信息的互補光譜模式的脂肪組譜的新證明。空間代謝組支持個性化定制。河南空間代謝組學基本研究流程

空間代謝組技術流程 。廣西3d空間代謝組學

空間代謝組學:利用基質進行空間成像——MALDI質譜分子成像技術MALDI-MSI分析中非常關鍵的一點是需要添加基質來吸收激光能量,實現被測物的離子化,主要對脂質類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達到數個微米。其中,MALDI和DESI成像技術目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術。這兩種技術與質譜相連,使用范圍有一定的互補性。二者結合使用,可實現“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點呢?廣西3d空間代謝組學

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