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北京單細胞BCR測序數據分析

來源: 發布時間:2022-06-01

相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,BD和10X這兩個平臺普遍提供的細胞數量都在1-6K不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托Random Cell Label技術,使得其對于NovaSeq、HiSeq?X?Ten、Hiseq 4000等設備存在的Index hooping現象,相對于Smart-Seq數據來說,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網站曾給出hooping測試結果,顯示無影響。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規模發現和復雜疾病研究的測序。北京單細胞BCR測序數據分析

當蜂巢孔內同時落入細胞和磁珠后,接下去可以往BD Cartridge板中加入細胞裂解液對細胞進行裂解,使細胞內的RNA與磁珠上的標簽進行結合,完成每個細胞內RNA的捕獲和標記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進行回收,待所有質控結果確認通過后就可以進行后續的RNA反轉錄、cDNA第二鏈合成等實驗操作。而BD Cartridge板則需要再進行一次成像,獲得磁珠收集后的掃描圖,判斷磁珠是否已經被有效收集。根據每一步的質控結果,烈冰科技(NovelBio)單細胞測序實驗團隊會根據單細胞分選的實驗結果生成實驗總結報告,判斷每一步驟是否通過質控,并得到捕獲的單細胞數量以及雙細胞比例,對整個實驗進行總結評估。若所有過程通過質控,實驗樣本即可進行下一步實驗操作。武漢單細胞測序平臺空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況,揭示精細病理區域的信號通路。

當下,單細胞測序已經廣泛應用于多種疾病發展過程中的關鍵過程和事件,如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發展,以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術,其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現在一個組織區域中他們會互相影響或者轉化么?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,這樣PDL1-PD1的關系會生效么?

同恒檢測可以實現方法開發驗證、配方成分檢測、元素分析測定、綜合解決方案、結構分析確證、指定成分分析、腐蝕分析、模擬實驗、未知物成分分析、異物分析工業診斷、含量檢測測定等服務項目,業務范圍不僅涵蓋了傳統的日化、消費品、金屬、材料、保健食品、農藥、紡織、涂料、醫療;還包含了現代熱點的5G通訊、人工智能、新能源產業;從精密的半導體芯片、生物制藥、細菌病毒到宏觀的橋梁建筑、航天工業、工業生產,同恒檢測始終堅持為您提供精益求精的服務。烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現多種RNA的一網打盡。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發展的快車道,烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發的NovelBrain?生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。搭建多種測序數據的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。南京BD VDJ測序多重熒光免疫組化

全線搭建BD Rhapsody單細胞測序平臺。北京單細胞BCR測序數據分析

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺實現了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,系統實現16個通道同時運行,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),并支持原Chromium Controller體統外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規模單細胞研究。北京單細胞BCR測序數據分析

上海烈冰生物醫藥科技有限公司致力于醫藥健康,是一家服務型的公司。公司業務分為單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等,目前不斷進行創新和服務改進,為客戶提供良好的產品和服務。公司將不斷增強企業重點競爭力,努力學習行業知識,遵守行業規范,植根于醫藥健康行業的發展。烈冰生物憑借創新的產品、專業的服務、眾多的成功案例積累起來的聲譽和口碑,讓企業發展再上新高。

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