機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。上海單細(xì)胞多組學(xué)測序公司
RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢:1)能夠動(dòng)態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá),多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動(dòng)中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充,多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。南京單細(xì)胞免疫組庫測序公司測序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。
免疫組庫測序有必要做嗎? 對(duì)于十的十二次方個(gè)以上的抗原識(shí)別基數(shù)來說,群體和個(gè)體間的免疫組庫的豐富程度能夠直接反應(yīng)機(jī)體免疫系統(tǒng)情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機(jī)體識(shí)別病原的能力越強(qiáng),越不容易患病,但超過一定限度,也容易引發(fā)自身免疫性疾病。且機(jī)體的免疫組庫也不是一成不變的,會(huì)隨著年齡,環(huán)境,藥物,患病等等因素,免疫組庫多樣性也時(shí)刻處于動(dòng)態(tài)變化當(dāng)中。由此,將免疫組庫測序用于臨床診斷和診療上,有助于對(duì)群體或個(gè)體間進(jìn)行免疫監(jiān)測,探究相關(guān)疾病和免疫應(yīng)答的關(guān)系,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制。
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對(duì)文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。高通量測序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。
烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國際前沿、整合添加多項(xiàng)國際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測序分析結(jié)果,詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Raw data(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后,就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進(jìn)行Spot的Cluster的過程,熟悉單細(xì)胞測序的研究者知道,Cluster在單細(xì)胞測序中往往表示為細(xì)胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype(當(dāng)然分情況也會(huì)有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性,導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。全轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)支持
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BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細(xì)胞和射出的磁珠碰撞的過程,進(jìn)行單細(xì)胞捕獲的技術(shù),轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù)。該技術(shù)用20萬+的微孔(該數(shù)量級(jí)遠(yuǎn)大于Input細(xì)胞數(shù)量),保證單孔中的單細(xì)胞捕獲。同時(shí)避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對(duì)會(huì)有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對(duì)),保證Input細(xì)胞的高效使用。對(duì)于Input細(xì)胞的量更少的情況,可以基于百萬級(jí)別的細(xì)胞總量開始進(jìn)行前期處理以及后期捕獲操作。 而在細(xì)胞捕獲完成后,進(jìn)行細(xì)胞裂解后,同樣的也進(jìn)行細(xì)胞中RNA polyA序列的抓取工作。上海單細(xì)胞多組學(xué)測序公司
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