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成都單細胞BCR測序數據分析

來源: 發布時間:2022-06-05

二代測序技術在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規模平行測序技術(massive parallel analysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,烈冰生物斥巨資購置的Novaseq6000測序儀的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構建、簇生成、測序和數據分析。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區分樣品來源;2)Adapter,用于結合測序通道上的位點;3)Primer binding site,用于結合PCR引物啟動擴增反應。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。成都單細胞BCR測序數據分析

免疫組庫是功能相似的n多細胞的統稱。而“免疫”是指免疫細胞,特指T/B淋巴細胞。“So~免疫組庫”(Immune Repertoire,IR),指某個體,特定時間點下,所有功能多樣性T/B淋巴細胞的總和。T/B細胞利用細胞表面受體(TCR/BCR)識別和結合抗原,介導機體產生針對性的免疫應答,發揮免疫功能并做好記錄備案,如果該抗原再次入侵可迅速作出反應,作為健康衛士守護肌體城池。基因片段V(D)J (Variable-可變區; Diversity-多樣區; joining-連接區;) 會發生隨機重組,各基因片段可變形式分別為,V區(52種),D區(2種),J區(13種),配合V(D)J片段中堿基的插入和缺失,進一步相互間的排列組合存在1012種以上組合形式,以此構成了TCR和BCR多樣性的來源,而這種多樣性正是適應性免疫系統能夠識別眾多抗原的基礎。廣州單細胞多組學測序數據分析烈冰開展了單細胞轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。

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所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與 傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。

單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經驗,100+組織類型解離protocol,精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術,確保凍存組織使用。 珍貴樣本,細胞數量太少,消化背景雜無法做單細胞? 采用國際認可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺模式,根據樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。 PCR Bias干擾基因表達? 采用BD單細胞UMI Barcode技術構建PCR無偏文庫,克服擴增偏差,更準確地計算轉錄水平。 單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分? 烈冰同時采用單細胞蛋白質組與單細胞轉錄組測序技術,真正做到從上游到下游的全線檢測,確保超高的細胞分類精度。搭建多種測序數據的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。深圳空間轉錄組測序數據分析

高通量測序技術是對傳統測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。成都單細胞BCR測序數據分析

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