10× Genomics單細胞方案要求使用具有較高活性的單細胞懸液。在實際實驗中，我們發現因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同，容易出現單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物對獲得高質量數據是至關重要的。這是因為，死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲，并會影響單細胞數據的質量。因此當樣本活性較差時，對細胞懸液中細胞活性檢測后，需要進行一般死細胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時考慮此操作），以保證較高的上機捕獲細胞的質量。測序可準確地分析基因表達差異、基因結構變異、篩選分子標記（SNPs或SSR）等生命科學重要問題。烈冰生物單細胞測序平臺

一味的追求高細胞數量的捕獲，小心得不償失，原因在這：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數據，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現明顯不同。而當細胞捕獲數過多時，無論是假陰性和假陽性數據還是多細胞數據，都會對正常細胞聚類產生影響，造成聚類結果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數在3000-5000個時，數據量在100G左右時，可以滿足分析和文章發表的多重需求。高通量測序單細胞測序服務機構深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。

單細胞多組學提升見解 基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處，因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息，那么單細胞多組學提供了同一細節的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10x Genomics Chromium單細胞平臺能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統方法不同，單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗，也節省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結果。這不但節省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學準確性，因為您不需要匹配拆分樣本的數據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數大約在50k左右；每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數普遍較少，導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養的如干細胞等，他們的基因表達數較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此，我們對細胞數量以及基因中位數確認時，需要考察實際組織的細胞組成。過去的十年，我們是知識的承載者；現在，我們在努力構建醫學的大數據時代；未來我們將重新定義知識形態！

針對單細胞測序的細胞數量判斷環節：主要是對細胞數量、基因表達量、測序質量進行整體描述。過濾標準：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導致數據存在background值。因此，我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例，細胞數量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點，當存在多個斜率拐點的時候，結合預期UMI=500時的細胞數量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候，選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準；否則，選擇和預期細胞數量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數量上可以分析的數據。十二年測序經驗，烈冰生物單細胞多組學領域的佼佼者。陜西10X Genomics單細胞測序數據分析可視化

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烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業，為科研學者提供專注的測序數據分析服務，先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細胞測序進入發展的快車道，烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司，依托自主研發的NovelBrain?生物大數據分析平臺，為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細胞類型，1000+靶標基因，10000+樣本處理經驗。烈冰生物單細胞測序平臺

上海烈冰生物醫藥科技有限公司辦公設施齊全，辦公環境優越，為員工打造良好的辦公環境。NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造是上海烈冰生物醫藥科技有限公司的主營品牌，是專業的生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】公司，擁有自己**的技術體系。公司不僅*提供專業的生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】，同時還建立了完善的售后服務體系，為客戶提供良好的產品和服務。自公司成立以來，一直秉承“以質量求生存，以信譽求發展”的經營理念，始終堅持以客戶的需求和滿意為重點，為客戶提供良好的單細胞測序，生物大數據云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序，從而使公司不斷發展壯大。