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長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺

來源: 發布時間:2022-08-01

單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個共同過程,即分離RNA并將其轉化為cDNA進行分析。不過,每種分析在開展方式和獲得的數據上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA,然后將其轉化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構建新一代測序文庫,從而測定整個轉錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點,并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點,而RNA-seq可實現無偏倚的全轉錄組基因表達分析。然而,這兩者只能提供細胞群體內基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應容器中。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA,確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似,帶有條形碼的cDNA也被用于構建新一代測序文庫,從而能夠對每個細胞的整個轉錄組進行基因表達測定。ATCG堿基的排列組合構成了測序的龐大世界。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺

烈冰生物搭建近10臺10XGemomics平臺,目前為全國范圍內的高校、醫院和研究所等單位的科研學者提供鼓舞,10X微流體“雙十字”交叉系統為8或16通道系統,每個通道上限可捕獲20000細胞,16通道一次可檢測細胞范圍為百萬級別的細胞水平。此外,單個細胞捕獲效率高達65%,可準確鑒別稀有細胞類型,利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究;細胞可適性高,對細胞大小(直徑超過40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制。細胞捕獲周期較短,能夠實現自動分離,無需人工操作,1天內可完成從細胞懸液到cDNA文庫構建的所有的測序準備工作。二代測序單細胞測序百萬通量平臺單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型。

多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深度解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!

烈冰科技專注為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發展的快車道,烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發的NovelBrain®生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。

科技的發展讓單細胞測序已經應用于疾病發展過程中的關鍵過程和事件,如前病變向惡性的轉化、惡性向轉移性的發展,以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術,其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現在一個組織區域中他們會互相影響或者轉化么?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,這樣PDL1-PD1的關系會生效么?烈冰單細胞多組學測序助您探究細胞類型特異性和基因調控網絡特征。南京10X Chromium X單細胞測序

深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺實現了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,系統實現16個通道同時運行,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),并支持原ChromiumController體統外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規模單細胞研究。長沙二代測序單細胞測序百萬通量平臺

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