在轉錄組學領域,空間轉錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉錄組學評價為2020年度方法,空間轉錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉錄組測序到實現單細胞轉錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助。現在,新的空間轉錄組方法不僅帶來轉錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。豐富的測序和數據分析經驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數據分析服務。深圳BD Rhapsody空間轉錄組測序服務
10XVisium的實驗主要分為兩部分:組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態(tài)學信息;組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序,記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息。具體實驗流程如下:A、切片制備和優(yōu)化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的mRNA得到釋放,并結合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息。C、逆轉和文庫構建:以捕獲的RNA為模板,進行cDNA合成,和測序文庫制備。D、高通量上機測序:對制備好的測序文庫,進行二代高通量短讀長測序。E、數據可視化分析:結合HE結果,確定哪些基因有表達,表達量高低,以及這些基因的空間位置信息青島上海烈冰生物空間轉錄組測序服務十二年測序經驗,烈冰生物空間轉錄組領域的佼佼者。
單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。
烈冰與國內高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉移機制,免疫研究、腦神經、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。空間轉錄組測序機構,請認準上海烈冰生物科技。
生命科學研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息,不僅可以推斷出相應未知基因的功能,揭示特定調節(jié)基因的作用機制,而且可以辨別細胞的類型和異質性,為疾病診斷提供理論依據。但由于研究的深入或具體研究方向和內容的不同,傳統的轉錄組測序技術顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心,更加直觀地反映組織中基因的表達情況,隨即單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空間轉錄組(Spatial transcriptomics,ST)測序等一系列技術應運而生。烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。南京空間轉錄組數據分析可視化
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烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據,從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發(fā)生的位置,這將有助于科學家更好地構建生物圖譜,并進一步理解疾病和生物學過程。目前,空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業(yè)的實驗團隊、豐富的切片經驗,配置了國際主流的儀器設備,實驗團隊針對不同組織類型優(yōu)化完善實驗方案,并制定了嚴謹規(guī)范的實驗室SOP流程,保證空間轉錄組切片的質量,全優(yōu)保障測序數據質量。深圳BD Rhapsody空間轉錄組測序服務
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