空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。在單細胞水平上的多組學分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數(shù)據(jù)。青島single cell RNA單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化

單細胞技術(shù)讓我們在基因組學、表觀基因組學、轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學等層面上解析了許多錯綜復雜的生命密碼。隨著科技的進步，我們發(fā)現(xiàn)整合多個組學的信息可以更仔細地觀察細胞之間的可變性，更清楚地識別特定細胞及其功能。單細胞多組學在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領(lǐng)域方面的應(yīng)用也將越來越廣。單細胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組，而是擴展到了基因組、免疫組、表觀組、蛋白組等多組學水平。合肥高通量測序單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)單細胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組，擴展到了基因組、免疫組、蛋白組等多組學水平。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值。然而，單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序，可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

單細胞測序技術(shù)（SingleCellSequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測序手段，幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)，在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后，又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持，幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。為了能深入分析和理解細胞狀態(tài)和命運決定的機制, 將單細胞各組學技術(shù)結(jié)合在一起的單細胞多組學技術(shù)產(chǎn)生。

SingleCellSequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)（NGS，NextGenerationSequencing）分析每一個單個細胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了，如何獲得單個細胞？如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個細胞？單個組織細胞群體通常在百萬級別以上，如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個細胞？單細胞測序成本非常高，尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候，如果單個細胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無法普及。所以，正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足，直到幾個突破性技術(shù)的誕生。在單細胞組學技術(shù)的支持下,早期妊娠母胎界面的異質(zhì)性問題得到了更深入的闡述與理解。無錫烈冰生物單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)

單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進程的變化，因此多組學聯(lián)合分析成為解析生命進程的有力工具。青島single cell RNA單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果，詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型，而應(yīng)該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。青島single cell RNA單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。一批專業(yè)的技術(shù)團隊，是實現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標的基礎(chǔ)，是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動力。誠實、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求，也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序。公司深耕單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序，正積蓄著更大的能量，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。