多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!深度的單細胞測序數據解讀助力生物健康醫療時代。無錫烈冰單細胞多組學商業化服務
基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環只上一個dNTP。每一輪循環結束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環數的增大會出現不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。深圳BD單細胞多組學數據分析單細胞多組學測序技術已應用于心肌再生領域。
烈冰與國內高校、研究所、醫院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯合發表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發生轉移機制,免疫研究、腦神經、白血病、胚胎發育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。
單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽,需要對細胞數量、細胞活性進行準確判斷,這對SingleCell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高,將會影響建庫的成功率;計數偏低,則會顯著提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數據的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。目前已應用的單細胞多組學聯合分析包括轉錄組和基因組,轉錄組和DNA甲基化、轉錄組和蛋白組。
單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態,在異質性發育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。單細胞多組學技術(single-cell multimodal omics) 是指在同一細胞中同時測量多種組學數據的前沿技術。濟南上海烈冰生物單細胞多組學數據分析
單細胞多組學突破了以往單細胞檢測的單一性,可更多樣化。無錫烈冰單細胞多組學商業化服務
單細胞多組學測序技術是在單細胞分辨率下精確分析細胞異質性和基因調控網絡的新技術,提供了全新的視角來分析細胞的分化路徑、細胞間的交互調控和細胞亞群的分離現象。轉錄組、表觀基因組、蛋白組學和代謝組學的差異賦予了組織內同樣基因組背景下的單個細胞的功能特異性。單個細胞的組學變化決定了組織的功能狀態,因此,闡明組織的細胞異質性是破譯生理功能和病理演變的關鍵。然而,以bulkRNA測序等為**的傳統方法掩蓋了細胞的異質性,細胞組學變化的平均水平。近10年來,單細胞組學技術應運而生,實現了在單細胞分辨率下研究分子的變化規律。無錫烈冰單細胞多組學商業化服務
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