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濟南烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-25

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置,從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領域的佼佼者。濟南烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!廣州BD空間轉(zhuǎn)錄組技術支持烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。

所謂的高通量測序技術,又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中,組織內(nèi)部的不同細胞經(jīng)歷了復雜的生物學過程,因此,組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個層面,細胞類型異質(zhì)性可由單細胞測序來完美呈現(xiàn),而空間位置的異質(zhì)性,則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表。測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構變異、篩選分子標記(SNPs或SSR)等生命科學重要問題。

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎的先進實驗平臺,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,判定空間區(qū)域內(nèi)的細胞類別,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。ATCG堿基的排列組合構成了測序的龐大世界。廣州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組測序服務

空間轉(zhuǎn)錄組測序技術的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。濟南烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序

烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表;專業(yè)實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學團隊提供個性化的產(chǎn)品應用場景解讀、保持對生物學意義的關注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境濟南烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序

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