烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節省您的工作時間并提升整體工作效率。附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。濟南烈冰生物空間轉錄組測序服務
當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,通過透化處理,細胞內的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉錄組的重點在于芯片部分:正式文庫構建的芯片上有4個捕獲區域(6.5mmX6.5mm,可以檢測4個樣本)每個捕獲區域含有約5000個被條形碼標記的點(barcodedspots)每個spot直徑55μm,每個spot能捕獲1-10個細胞spot與spot中心點之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結合的捕獲探針,每個探針上都帶有獨特的spatialbarcodes,用以標記捕獲的mRNA的空間位置。上海烈冰空間轉錄組商業化服務烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。
烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據,從而可以區分和定位功能基因在特定組織區域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發生的位置,這將有助于科學家更好地構建生物圖譜,并進一步理解疾病和生物學過程。目前,空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業的實驗團隊、豐富的切片經驗,配置了國際主流的儀器設備,實驗團隊針對不同組織類型優化完善實驗方案,并制定了嚴謹規范的實驗室SOP流程,保證空間轉錄組切片的質量,全優保障測序數據質量。
10XVisium的實驗主要分為兩部分:組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態學信息;組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序,記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息。具體實驗流程如下:A、切片制備和優化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優化確定切片是否覆蓋靶向區域。B、切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的mRNA得到釋放,并結合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息。C、逆轉和文庫構建:以捕獲的RNA為模板,進行cDNA合成,和測序文庫制備。D、高通量上機測序:對制備好的測序文庫,進行二代高通量短讀長測序。E、數據可視化分析:結合HE結果,確定哪些基因有表達,表達量高低,以及這些基因的空間位置信息烈冰智造空間轉錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。
多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!烈冰引進國際主流空間轉錄組測序平臺,提供保留組織內部精細區域的空間信息的轉錄組測序。武漢scRNA空間轉錄組數據分析
烈冰測序數據分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數據,制定多套流程;濟南烈冰生物空間轉錄組測序服務
生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】是我國國民經濟重要組成部分之一,具有高產出、高危險、高技術密集型特點,有很強的技術壁壘。而且對于保護和增進大家健康、提高生活質量,為計劃生育、救災防疫、**戰備以及促進經濟發展和社會進步均具有十分重要的作用。打造一批以為依托的“互聯網+醫藥健康”協作平臺。這定將給相關企業,帶來非常大的發展機遇。2019年醫藥健康新政頻出,無論是醫藥研發企業還是生產企業,都面臨了很多挑戰??傮w而言,健康科技行業前景光明。在過去五年里,這一行業的穩健增長已經給未上市有限責任公司(自然)公司帶來逾270億美元的收入,14家公司的估值超過10億美元。另外,2019年退出總價值已經超過2018年,達到創紀錄的80億美元,這在很大程度上是因為強勁IPO的推動。隨著西方健康服務理念的進入及國內需求市場的飛速增長,國內以體檢為重點的有限責任公司(自然)得到了飛速發展,尤其是近年來,健康服務機構飛速發展。盡管中國老年健康服務目前仍處于初始發展階段,但近年來我國出臺了一些扶持政策,市場空間逐漸打開。濟南烈冰生物空間轉錄組測序服務
上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家有著雄厚實力背景、信譽可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標,有組織有體系的公司,堅持于帶領員工在未來的道路上大放光明,攜手共畫藍圖,在上海市等地區的醫藥健康行業中積累了大批忠誠的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發展奠定的良好的行業基礎,也希望未來公司能成為*****,努力為行業領域的發展奉獻出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態度和不斷的完善創新理念以及自強不息,斗志昂揚的的企業精神將**上海烈冰生物醫藥科技供應和您一起攜手步入輝煌,共創佳績,一直以來,公司貫徹執行科學管理、創新發展、誠實守信的方針,員工精誠努力,協同奮取,以品質、服務來贏得市場,我們一直在路上!