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杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-30

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中,組織內(nèi)部的不同細(xì)胞經(jīng)歷了復(fù)雜的生物學(xué)過程,因此,組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學(xué)研究的一個(gè)重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細(xì)胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個(gè)層面,細(xì)胞類型異質(zhì)性可由單細(xì)胞測序來完美呈現(xiàn),而空間位置的異質(zhì)性,則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、空間信息標(biāo)記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),助力高分文章發(fā)表。空間轉(zhuǎn)錄組測序機(jī)構(gòu),請認(rèn)準(zhǔn)上海烈冰生物科技。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

細(xì)胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學(xué)非常重要。但是scRNA-Seq在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題,通過記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學(xué)信息;通過免疫熒光進(jìn)行蛋白組檢測,將基因表達(dá)譜映射回組織樣本中的原始位置,同時(shí)獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué),發(fā)育生物學(xué),免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達(dá)情況的新視角。上海上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰對于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫測序分析。

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學(xué)研究。空間轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路,完成分子特征驅(qū)動(dòng)病理特征的機(jī)制解析。空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的技術(shù)革新,對于診斷標(biāo)志物、耐藥位點(diǎn)以及靶向藥物的研發(fā),免疫治等新興領(lǐng)域都具有重要作用。當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時(shí),通過透化處理,細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機(jī)測序,可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中,通過添加基因表達(dá)維度,得出形態(tài)學(xué)結(jié)論,通過觀察基因表達(dá)區(qū)域,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué),研究免疫細(xì)胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征;免疫群體擴(kuò)散、不同類型免疫細(xì)胞的空間位置解析; 在神經(jīng)科學(xué),研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學(xué),通過解析每個(gè)發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征,解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因;豐富基因表達(dá)的空間注釋信息,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。空間轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號通路。

空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù),可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,同時(shí)能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相?,空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數(shù)據(jù)映射在?起,進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。蘇州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

烈冰科技已建立了基于空間轉(zhuǎn)錄組的高通量測序?qū)嶒?yàn)多平臺。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

單細(xì)胞測序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進(jìn)行高通量測序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學(xué)突破。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

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