已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組測序可識別重要的轉錄因子,進行譜系和發育追蹤。烈冰科技空間轉錄組測序價格
烈冰提供空間轉錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數字掃描儀為基礎的先進實驗平臺,并制定嚴格規范的實驗室SOP,經過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優化,確保獲得更好質量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉錄組分析流程,準確快速解析空間轉錄組數據。取同一樣本組織的相鄰區域進行單細胞轉錄組測序,通過單細胞轉錄組數據和空間轉錄組數據的整合分析,判定空間區域內的細胞類別,精確解析組織空間內的異質化信息。重慶BD Rhapsody空間轉錄組商業化服務烈冰開展了空間轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。
烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。
空間轉錄組測序是在組織原位檢測全轉錄組基因表達的?種技術,可以展?組織切?中不同區域的基因表達情況,同時能夠得到?的基因在組織內部的空間位置信息。與傳統的全基因轉錄組或單細胞轉錄組測序相?,空間轉錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數據映射在?起,進?可以分析組織切內部空間結構的細胞異質性。常規單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環境,將成為發育生物學、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器。十二年測序經驗,烈冰生物空間轉錄組領域的佼佼者。
基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環只上一個dNTP。每一輪循環結束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環數的增大會出現不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。烈冰一站式多平臺測序服務:立足科學研究,解碼生命本質。寧波上海烈冰生物空間轉錄組測序價格
截至2021年10月,烈冰助力發表空間轉錄組測序文章近20篇。烈冰科技空間轉錄組測序價格
空間轉錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態學結論,通過觀察基因表達區域,了解可能發生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結構-功能關系,正常vs.疾病大腦結構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層; 在發育生物學,通過解析每個發育階段不同解剖區域特有的基因表達特征,解析組織中與形態形成相關基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創建組織發育的空間細胞圖譜。烈冰科技空間轉錄組測序價格
上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家有著雄厚實力背景、信譽可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標,有組織有體系的公司,堅持于帶領員工在未來的道路上大放光明,攜手共畫藍圖,在上海市等地區的醫藥健康行業中積累了大批忠誠的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發展奠定的良好的行業基礎,也希望未來公司能成為*****,努力為行業領域的發展奉獻出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態度和不斷的完善創新理念以及自強不息,斗志昂揚的的企業精神將**上海烈冰生物醫藥科技供應和您一起攜手步入輝煌,共創佳績,一直以來,公司貫徹執行科學管理、創新發展、誠實守信的方針,員工精誠努力,協同奮取,以品質、服務來贏得市場,我們一直在路上!