高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業生物背景和十二年科研服務經驗,已助力Nature,immunity等在內的300+篇CNS文章發表。空間轉錄組測序是高通量測序下的又一重大技術突破。廈門烈冰生物空間轉錄組商業化服務
空間轉錄組學(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學研究。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況,揭示精細病理區域中激發的信號通路,完成分子特征驅動病理特征的機制解析。空間轉錄組學完成了病理數字化結合病理影像化的技術革新,對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發,免疫治等新興領域都具有重要作用。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,通過透化處理,細胞內的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。空間轉錄組多組學測序空間轉錄組測序可識別重要的轉錄因子,進行譜系和發育追蹤。
空間組測序技術,作為現階段單細胞技術的重要補充技術進入了組學的實驗領域以及生物信息學的分析領域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉錄組測序(空間表達尺度)+數字病理(臨床診斷尺度)聯合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態系統,多角度深入分析組織的形態特征、基因組學特征、表觀遺傳調控因子以及樣本中的免疫微環境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉錄組分析實際上是非常需要研究者和企業之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉錄組測序結果的系統也是空轉分析中不可或缺的一環,也是重中之重。
空間轉錄組研究的的必耍性:研究單細胞是想要探究細胞間的異質性,但是常規的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液,然后利用單細胞分離技術(微孔,微板,液滴)等方法實現單細胞建庫,這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發展空問轉錄組技術實現細胞的位置信息的保留,對研究此類細胞狀態尤為必要。空間轉錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“天花板”。
烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據,從而可以區分和定位功能基因在特定組織區域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發生的位置,這將有助于科學家更好地構建生物圖譜,并進一步理解疾病和生物學過程。目前,空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業的實驗團隊、豐富的切片經驗,配置了國際主流的儀器設備,實驗團隊針對不同組織類型優化完善實驗方案,并制定了嚴謹規范的實驗室SOP流程,保證空間轉錄組切片的質量,全優保障測序數據質量。空間轉錄組測序技術提供了空間轉錄組水平下的科學研究視角。青島scRNA空間轉錄組商業化服務
十二年測序經驗,烈冰生物空間轉錄組領域的佼佼者。廈門烈冰生物空間轉錄組商業化服務
烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發表;專業實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業的生物學團隊提供個性化的產品應用場景解讀、保持對生物學意義的關注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環境廈門烈冰生物空間轉錄組商業化服務
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