轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的分析。轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進行親和純化的RNA聚合酶II轉錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的數字化信號，是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。FFPE空間轉錄組技術原理 為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況，揭示精細病理區域的信號通路。合肥BD空間轉錄組多組學測序

解決空間轉錄組測序數據分析中由于超大數據量、超高的質控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難，做到快速可定制化完成空間轉錄組分析；擁有行業先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數字切片掃描儀，可以同時實現明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像；Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式，進一步提升分辨率和清晰度，保證切片高分辨的數字圖像信息精細采集；能夠滿足針對分析結果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像，獲取表達與定位信息。烈冰生物空間轉錄組多組學測序烈冰斥巨資引進Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀元。

10XVisium的實驗主要分為兩部分：組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態學信息；組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息。具體實驗流程如下：A、切片制備和優化：取新鮮組織、冷凍、切片，并進行HE染色成像，優化確定切片是否覆蓋靶向區域。B、切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上，并進行固定和透化，使細胞中的mRNA得到釋放，并結合到相應的捕獲探針上，從而獲取基因表達信息。C、逆轉和文庫構建：以捕獲的RNA為模板，進行cDNA合成，和測序文庫制備。D、高通量上機測序：對制備好的測序文庫，進行二代高通量短讀長測序。E、數據可視化分析：結合HE結果，確定哪些基因有表達，表達量高低，以及這些基因的空間位置信息

10XGenomics和Drop-Seq的技術原理。是利用十字交叉的通道，從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，縱向孔道輸入細胞，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術，將之輸入到油相孔道中。這時候，就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫，進而完成細胞中RNA的捕獲過程。十二年測序經驗，累計服務與5000余項重要科研項目。

烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據，從而可以區分和定位功能基因在特定組織區域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動，并繪制活動發生的位置，這將有助于科學家更好地構建生物圖譜，并進一步理解疾病和生物學過程。目前，空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業的實驗團隊、豐富的切片經驗，配置了國際主流的儀器設備，實驗團隊針對不同組織類型優化完善實驗方案，并制定了嚴謹規范的實驗室SOP流程，保證空間轉錄組切片的質量，全優保障測序數據質量。全線搭建10x Genomics空間轉錄組測序平臺。無錫scRNA空間轉錄組平臺

空間轉錄組測序技術的迅速發展和應用推廣，為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。合肥BD空間轉錄組多組學測序

空間轉錄組研究的的必耍性：研究單細胞是想要探究細胞間的異質性，但是常規的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液，然后利用單細胞分離技術（微孔，微板，液滴）等方法實現單細胞建庫，這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發生空間位置的信息顯得尤為重要，因此發展空問轉錄組技術實現細胞的位置信息的保留，對研究此類細胞狀態尤為必要。合肥BD空間轉錄組多組學測序

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