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上海BD Rhapsody單細胞服務機構

來源: 發布時間:2022-09-07

BDRhapsody單細胞轉錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,針對多種組織類型的樣本,采用BD細胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BDRhapsody單細胞捕獲系統,BDRhapsodyTM單細胞捕獲系統采用微孔技術,對細胞的捕獲沒有偏好性,實現高達80%的微孔板捕獲率,由于單個微孔板中容納了22萬+個微孔,而現階段單細胞測序實驗技術通常要求單個樣本捕獲3000-5000,至高達10000個細胞,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細胞的無限稀釋過程,但22萬+微孔的存在,也對大體量細胞數目的科學研究有很好的包容性,細胞通量分為可擴展至100-40000個細胞的捕獲(單個微孔板),滿足您的多重需求。長沙BD單細胞測序公司單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺實現了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,系統實現16個通道同時運行,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),并支持原ChromiumController體統外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規模單細胞研究。

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數大約在50k左右;每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數普遍較少,導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養的如干細胞等,他們的基因表達數較高,甚至可以超過1W,這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此,我們對細胞數量以及基因中位數確認時,需要考察實際組織的細胞組成。烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發表。

基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學提供了同一細節的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BDRhapsody單細胞平臺以來,能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統方法不同,單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗,也節省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結果。這不但節省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。十二年測序經驗,累計服務與5000余項重要科研項目。深圳BD單細胞服務機構

此外,烈冰開展了單細胞轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案,歡迎垂詢。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

根據烈冰多年單細胞測序服務經驗,為什么不建議您一味的追求高細胞數量的捕獲:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,而細胞聚類是在區分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,通過降維(pca),無監督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數據,在剔除幾個細胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會出現明顯不同。而當細胞捕獲數過多時,無論是假陰性和假陽性數據還是多細胞數據,都會對正常細胞聚類產生影響,造成聚類結果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數在3000-5000個時,數據量在100G左右時,可以滿足分析和文章發表的多重需求。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

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