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杭州BD Rhapsody空間轉錄組測序服務公司

來源: 發(fā)布時間:2022-09-11

10XGenomics和Drop-Seq的技術原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術,將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。烈冰空間轉錄組測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調控網絡特征。杭州BD Rhapsody空間轉錄組測序服務公司

10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。南京BD Rhapsody空間轉錄組多組學測序烈冰測序數據分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數據,制定多套流程;

空間組學可以應用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經質細胞趨向于阿爾茨海默神經班。 2.建立空間轉錄組圖譜構建個人空間轉錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍區(qū)胚胎發(fā)育的動態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉錄組研究。10xGenomics公司已經測試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟

已發(fā)表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組測序技術遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。

烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表;專業(yè)實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學團隊提供個性化的產品應用場景解讀、保持對生物學意義的關注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境空間轉錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域的信號通路。武漢空間轉錄組商業(yè)化服務

烈冰引進國際主流空間轉錄組測序平臺,提供保留組織內部精細區(qū)域的空間信息的轉錄組測序。杭州BD Rhapsody空間轉錄組測序服務公司

基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認的一種基因檢測標準。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,被稱為下一代測序技術(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,可以說,基因測序技術將是下一個改變世界的技術。杭州BD Rhapsody空間轉錄組測序服務公司

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