由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P的測序成本，使得單細胞實驗往往非常昂貴，烈冰生物BDRhapsody單細胞測序服務珍視您的每一份樣本，在平臺搭建前，我們測試評估了BDRhapsody的性能，與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看，將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序（每個細胞月8700個讀數(shù)）。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下，每個細胞中，來自每個細胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠，這表明微孔之間的串擾非常小，在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下，多重態(tài)發(fā)生率接近零，并且在15000個細胞下小于5%。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細胞測序服務。濟南BD Rhapsody單細胞服務機構

現(xiàn)有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合，通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細胞和Beads進行分隔，在這個空間，單個細胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引，以便下游識別。BDRhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術（Cyto-Seq具有類似的技術原理）。通過微孔板的物理分隔，將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠，一對一的“框”在微反應的物理平臺中。這樣，每一個細胞都會結(jié)合一個磁珠，那么在每一個磁珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這個抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫。廣州scRNA單細胞平臺搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺，5000+項目檢驗，真實可信賴。

為什么需要單細胞分辨率？生物學就像宇宙一樣。它非常復雜，有許多獨特的單體，也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究，闡明具體細節(jié)，構建出一幅更大、更精細的圖譜，說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。

針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質(zhì)量進行整體描述。過濾標準：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10×Genomics為例，細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMICounts-Barcode曲線斜率拐點，當存在多個斜率拐點的時候，結(jié)合預期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候，選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準；否則，選擇和預期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。烈冰生物全國五大實驗中心，多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺，助您的樣本更快速抵達“戰(zhàn)場”。

據(jù)不完全統(tǒng)計，截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10XGenomics和BDRhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Naturecellbiology,NaturePlants，Naturecommunication）,風濕類領域ARD期刊1篇，CUT1篇，AdvancedScience多篇，IF大于10分以上文章占比高達68.5%，烈冰專屬單細胞測序服務團隊，將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。廣州scRNA單細胞多組學測序

BD平臺基于cyto-seq技術，實現(xiàn)細胞和磁珠的一對一結(jié)合。濟南BD Rhapsody單細胞服務機構

什么時候要用到去死細胞的操作呢？跟進烈冰生物多年單細胞測序服務經(jīng)驗來看，當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài)，失真嚴重，建議重新收集樣本進行新的實驗，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性。但需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時，盡可能提供足量的細胞，以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題，BDRhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低，一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。濟南BD Rhapsody單細胞服務機構

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