多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深度解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!單細胞測序技術遍地開花,烈冰BD 單細胞測序服務讓您的醫學研究如虎添翼。scRNA單細胞
BDRhapsody單細胞轉錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,針對多種組織類型的樣本,采用BD細胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細胞,基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。廣東BD單細胞服務機構單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。
單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽,需要對細胞數量、細胞活性進準判斷,這對SingleCell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高,將會影響建庫的成功率;計數偏低,則會提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數據的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。
從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數據集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數據,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產力、減少因批次效應引起的錯誤,并節省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。豐富的測序和數據分析經驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數據分析服務。
現有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內的動態結合,通過油相水相不相容的特點將結合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,單個細胞的內容物釋放,轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別。BDRhapsody單細胞測序平臺采用靜態微孔技術(Cyto-Seq具有類似的技術原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,一對一的“框”在微反應的物理平臺中。這樣,每一個細胞都會結合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫。此外,烈冰開展了單細胞轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案,歡迎垂詢。天津BD單細胞轉錄組測序
從樣本處理到終端數據分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務。scRNA單細胞
關于BDRhapsody單細胞平臺的樣本類型和樣本制備:在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊,獲得分離良好的細胞懸液、且細胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉錄本數量有關。各種尺寸不同的細胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達解決方案中使用的BDRhapsody平臺兼容。一般來說,細胞制備方案將根據組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細胞實驗之前優化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。scRNA單細胞
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