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上海烈冰科技單細胞多組學測序服務

來源: 發布時間:2022-09-17

相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,BD和10X這兩個平臺普遍提供的細胞數量都在1-6K不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型。因此,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托RandomCellLabel技術,使得其對于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等設備存在的Indexhooping現象,相對于Smart-Seq數據來說,影響幾乎可以忽略不計(10XGenomics官方網站曾給出hooping測試結果,顯示無影響。未來,單細胞多組學測序技術的策略會繼續向轉錄組結合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發展。上海烈冰科技單細胞多組學測序服務

所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。廈門上海烈冰生物單細胞多組學技術支持,從多組學的角度對單細胞進行綜合分析 將是未來單細胞技術的必由之路。

高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業生物背景和十二年科研服務經驗,已助力Nature,immunity等在內的300+篇CNS文章發表。

未來,單細胞多組學測序技術的發展,一方面將集中在對現有技術的優化和新方法的開發.現有技術的優化不僅包括建庫手段、測序技術和算法工具等方面,還包括優化實驗設計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學和物理等多學科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發現更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發育的細胞分化軌跡.新方法則可以更多地關注目前未能檢測到的一些重要的基因表達調控層面,如DNA三維結構、非編碼RNA和胞內蛋白等.另一方面,目前的單細胞多組學測序技術發展勢頭強勁,研究者不斷研發并豐富著單細胞測序工具箱,各種組學方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩定、通用、成本低、可商業化的方法,并進一步擴大其實際應用范圍。單細胞多組學突破了以往單細胞檢測的單一性,可更多樣化。

單細胞技術讓我們在基因組學、表觀基因組學、轉錄組學和蛋白質組學等層面上解析了許多錯綜復雜的生命密碼。隨著科技的進步,我們發現整合多個組學的信息可以更仔細地觀察細胞之間的可變性,更清楚地識別特定細胞及其功能。單細胞多組學在臨床診斷、疾病分型以及細胞發展機制這些重大生命科學領域方面的應用也將越來越廣。單細胞技術從 2009 年發展到現在,研究范圍不再局限于轉錄組,而是擴展到了基因組、免疫組、表觀組、蛋白組等多組學水平。在單細胞水平上的多組學分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數據。北京上海烈冰生物單細胞多組學多組學測序

單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構建、高通量測序和生物信息學分析等步驟。上海烈冰科技單細胞多組學測序服務

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節省您的工作時間并提升整體工作效率。上海烈冰科技單細胞多組學測序服務

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