甲基化-焦磷酸測序（升級版）之前的儀器是Q96，也就是說同時可以上96個反應，但是有效讀長只有50bp左右（50bp之后開始衰減，后面的序列只能作為參考）；升級版的Q48，也就是48孔，每次上48個反應，但有效長度可以到100bp左右，而且之前很多不能測過去的特殊結構，現在大部分也能測了。甲基化--------焦磷酸測序的優勢。樣品要求·樣品類型細胞、新鮮組織或DNA樣品·樣品量細胞樣品請提供至少1×106個細胞，組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片，DNA樣品請提供1μg以上的DNA·樣品質量基因組DNA無明顯降解，主帶清晰，大于23Kb，無明顯彌散。OD260/280值在～，濃度≥50ng/μl·樣品保存細胞樣品或新鮮組織塊（切成～50mg的小塊）可液氮凍存后，-80℃保存。DNA樣品可溶于乙醇或超純水中，-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融·樣品運輸樣品置于ml凍存管中，封口膜封好。 6mA在細菌、藻類及動植物基因組中存在。山東Chip-seq技術服務專業服務

    焦磷酸測序(Pyrosequencing)隨著技術的不斷改進，現在認為焦磷酸測序技術（Pyrosequencing）是甲基化檢測新的金標準。焦磷酸測序作為一種新的序列分析技術，能夠快速地檢測甲基化的頻率，對樣品中的甲基化位點進行定性及定量檢測，為甲基化研究提供了新的途徑。在序列延伸過程中，根據C和T的摻入量來定量確定單個位點的C-T比例。因此，不同位點的甲基化變異就能被準確檢測，并給出精確的甲基化程度的數據。QIAGEN公司在焦磷酸測序的應用上具有明顯的優勢，目前提供三種焦磷酸測序儀器，通量由低到高，適合不同的應用。PyroMarkQ24的強項在于可對多達24個樣品進行焦磷酸測序。需要大樣品量的應用更適合在PyroMarkQ96ID上進行。在考慮到處理成百上千個樣品所需的大量試劑時，運行通量**化可能會使實驗成本變得很高。而PyroMarkQ96MD裝有一臺高度靈敏的光檢測攝像頭，可以在減少試劑量的情況下對少量的DNA模板進行準確測序。這些不同平臺的推出，對于我們實際研究提供了更有效的檢測手段。 廣東MeDIP-Seq技術服務服務羥甲基化DNA免疫沉淀測序是通過5hmC特異性抗體富集結合高通量測序技術。

    cfDNABS-Seq送樣要求一、送樣類型分離好的血漿二、保存方式分離后的血漿，用ml離心管分裝，例如：1ml/管；放-20℃冰箱中保存（短暫保存，1-2周）；放-80℃冰箱中長期保存(1年以內)；保存期間不能凍融。三、運輸條件干冰運輸：順豐陸運（3-4天時間），夏季10-15公斤干冰；秋冬季10公斤干冰。四、抽血要求1、使用Streck**管（不建議使用普通的EDTA-鈉抗凝管），采集10ml外周靜脈血（客戶沒有Streck**管，公司配送）；2、室溫或者放置4℃冰箱中半小時以上，不超過8小時，進行血漿分離步驟。五、血漿分離步驟1、4℃條件下以1600g離心10min，離心后將上清（血漿）分裝到2、4℃條件下以16000g離心10min去除殘余細胞，將上清移入新的離心管中，每管分裝1ml;3、血漿樣本存放于-80℃冰箱中保存;使用干冰運輸,提取之前不能凍融。備注1：血漿分離在4℃條件進行，如果客戶沒有冷凍離心機，也可以在室溫條件下進行；備注2：離心后取血漿上清，避免吸取白細胞；通常10ml全血可以獲得4-5ml血漿。

相比之下，VeraCode GoldenGate甲基化分析技術更適合中通量的篩選及驗證研究，它以以矩陣微珠芯片(Sentrix Array Matrix(SAM)）形式分析48至384個用戶指定的CpG位點。首先，將亞硫酸氫鹽處理的基因組DNA 與分析oligo混合，oligo與未甲基化位點的U互補，或者與甲基化位點的C互補。雜交之后，引物延伸，并連接上位點特異的oligo來產生通用 PCR的模板。***，用標記的PCR引物生成可檢測的產物。據Illumina的產品**介紹，其產品的**優勢在于單個CpG位點的分辨率。其它分析將甲基化定位在一段區域，而通過Illumina分析，你能精確測定某個CpG位點的甲基化水平。5mc是表觀遺傳重要的一種修飾，存在于植物、動物等真核生物基因組中，被譽為“第五堿基”。

    亞硫酸鹽結合測序是DNA甲基化檢測的“金標準”方案。除了全基因組甲基化測序等研究手段，對于目標基因/位點檢測或者轉化醫學應用研究來說，需要靈活的靶向甲基化測序方案。BSP(BisulfiteSequencingPCR)結合高通量測序的TargetBisulfiteSequencing滿足幾個到上百個基因/位點的驗證需求,具有高通量、低成本的優勢,***用于臨床大樣本多位點的甲基化biomarker篩選及高水平文章甲基化驗證環節。微生物定植對腸道免疫和代謝相關基因DNA甲基化的影響——團隊成員發表.(IF=)我們以早產幼豬為模型，利用RRBS測序比較正常(n=7)和口服***(n=7)的腸道DNA甲基化差異，發現與先天免疫應答、吞噬和代謝等相關基因的DNA甲基化和表達存在***的差異，并通過高通量BSP測序對EGFL7、LBP8、PTPRE差異甲基化基因進行了驗證。 基于高通量測序平臺的甲基化圖譜分析。四川Chip-seq技術服務活動

提供樣本DNA完整性質檢結果。山東Chip-seq技術服務專業服務

DNA甲基化對基因表達調控起著動態的重要作用。 借助MethylationEPIC BeadChip，研究人員可以基于單核苷酸分辨率定量檢測基因組中的850,000多個甲基化位點。包括FFPE在內的多重樣本可以并行分析，以便在每樣本比較低成本的情況下實現高通量功能。依托業界**的Infinium實驗分析方法，MethylationEPIC BeadChip是全表觀基因組關聯研究(EWAS)的理想之選。它提供了由**精選的***的覆蓋范圍，囊括99%的RefSeq基因，95%的CpG島，高覆蓋度的增強子區域和其他內容類別。由于超過90%的Infinium HumanMethylation450K位點內容都涵蓋在內，因此新一代MethylationEPIC試劑盒對這些位點也完全支持。山東Chip-seq技術服務專業服務