羥甲基化DNA免疫沉淀測序（HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，hMeDIP-Seq）是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找羥甲基化區域。可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發育過程中的研究。樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150;測序深度：20-30Mreads。信息分析：基于全基因組范圍的羥甲基化分析，數據質控，Peak鋒Calling，Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布，多樣本羥甲基化差異聚類，差異羥甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。焦磷酸測序技術是甲基化檢測新的金標準。浙江6mADNA甲基化口碑推薦

industryTemplate浙江hMeDIP-SeqDNA甲基化售后服務通過甲基化數據與耐藥基因Panel數據聯合分析。

上皮型鈣黏附素（E-cadherin）是介導細胞間粘附的一種跨膜糖蛋白，其編碼基因CDH-1屬于**侵襲轉移抑制基因。在**組織中，E-cadherin表達的下調或沉默可導致細胞間相互黏附力減弱，造成**細胞的分散，脫離原發灶處而轉移。而E-cadherin下調的因素之一就是其啟動子區域CpG島的超甲基化。**細胞突破血管內皮及基底膜進入血循環是**細胞侵襲和轉移的重要步驟。基底膜組成蛋白Nidogen的缺失將嚴重影響基底膜的完整性，有利于**細胞順利通過進入血循環進而發生侵襲轉移。有研究表明，Nidogen基因啟動子在**細胞中表現出很高的甲基化水平，而在正常細胞中卻極少或沒有發生甲基化。另外，某些miRNA（如MiR-148a、miR-34b/c、miR-9）能夠起到抑制**細胞生長和轉移的作用，而在**細胞中，這些miRNA通常由于發生超甲基化而沉默。

芯片種類：Agilent**甲基化芯片，8x60K●和合作伙伴在Agilent公司定制的Promoter芯片。●絕大多數基因是針對基因啟動子區域的CpG島設計探針。●芯片上一共有4160個功能注釋比較明確的基因，其中2128個和**發生有關系。●從功能上分，有256基因和細胞凋亡有關，1273個基因和信號傳導有關，487個基因和壓力和衰老有關。●特別適用于**甲基化研究。案例分析：用Agilent定制甲基化芯片和表達譜芯片共同篩選乳腺*患者的高甲基化基因，并探討甲基化與基因表達的關系為了尋找乳腺*早期診斷的甲基化標記基因，探討基因甲基化水平與基因表達量之間的關系，科研者使用甲基化芯片和表達譜芯片進行了相關研究。研究中，甲基化程度檢測使用BSP法和COBRA分析，基因表達水平檢測用RT-PCR。結果，在乳腺*患者中檢測到70對高度甲基化差異***的基因，表達譜芯片分析結果顯示在乳腺*患者中這70個基因大部分不表達；RT-PCR結果也顯示大部分基因表達量很低甚至不表達。這種研究策略，能夠直觀方便的篩查患者甲基化基因，有效地尋找乳腺*標記基因，對研究甲基化基因調控基因表達提供研究基礎。焦磷酸測序能提供基于序列測定的SNP檢測、等位基因頻率分析和甲基化檢測。

第三代測序技術的出現，更是讓甲基化的直接測定成為可能。一年前，美國PacificBiosciences公司利用獨有的單分子實時(SMRT)測序技術，直接測定了DNA的甲基化。這項成果發表在《NatureMethods》雜志上。甲基化特異性PCR（MS-PCR）：DNA在亞硫酸氫鹽作用后，DNACpG若無甲基化，則序列中的C改變為U，若有甲基化則保持不變，因此從理論上講，用不同的引物做PCR，即可檢測出這種差異，從而確定基因有無CpG島甲基化。因此根據目的基因修飾前后的改變，就可以相應設計M和U引物，有時我們需要設計兩輪引物。這種方法靈敏度高，無需特殊儀器，因此經濟實用，是目前應用**為***的檢測方法。不過也存在一定的局限性，預先需要知道待測片段的DNA序列，引物的設計非常重要。另外，亞硫酸氫鹽處理也十分關鍵，若處理不完全則可能導致假陽性的出現。基于高通量測序平臺的甲基化圖譜分析。山東850K芯片DNA甲基化怎么樣

羥甲基化DNA免疫沉淀測序是通過5hmC特異性抗體富集結合高通量測序技術。浙江6mADNA甲基化口碑推薦

焦磷酸測序（Pyrosequencing）技術服務基于QIAGEN公司的PyroMarkQ96ID平臺，能提供基于序列測定的SNP檢測、等位基因頻率分析和甲基化檢測，雜合子缺失及細菌和病毒分型等技術服務。優勢：得到定量序列結果的技術，極高的準確性，重現性**，實驗設計靈活。應用：可以用于任何遺傳多態性的分析甲基化研究的平臺通量、低成本的快速臨床微生物診斷。報告模板：1材料1.1試劑與試劑盒1.2儀器2方法2.1DNA抽提2.1甲基化修飾2.2純化亞硫酸鹽修飾的DNA2.3甲基化PCR2.4Pyrosequencing檢測。浙江6mADNA甲基化口碑推薦