隨著測序技術的發展，對微生物群（微生物組）的研究逐漸加深，研究熱點越來越多集中于環境和生物體相互作用的微生物群。加之測序成本降低，分析技術不斷提升，都使得宏基因組測序技術得到普遍應用。為什么要做宏基因組：宏基因組相對16S來說其物種分辨率會更高，隨著物種測序完成越來越多，數據庫更加完善，在腸道菌群方面基本能實現97%以上的菌都能鑒定到種，90%以上到菌株層面。而且可以同時獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現，可以直接通過大規模宏基因組測序不只找到可能的菌，進一步還能鑒定出特定候選基因區段。起初應用于微生物檢測的分子生物學技術是基因探針的方法。長沙水體微生物分析多少錢

病毒宏基因組學：是在宏基因組學理論的基礎上，結合現有的病毒分子生物學檢測技術而興起的一個新的學科分支，是某類樣本中所有病毒(virus)或病毒類似物(virus-like-particle)及其所攜帶遺傳信息的總稱。宏病毒組直接以環境中所有病毒的遺傳物質為研究對象，能夠快速準確的鑒定出環境中所有的病毒組成，在病毒發現、病毒溯源、微生物預警等研究方面具有重要作用。宏病毒研究可應用于人或動物腸道或者血液樣本、海洋、土壤等的研究，用以挖掘潛在的對人類和環境的危害。長沙土壤微生物多樣性測序多少錢可以通過控制微生物的生長環境來判斷微生物的種屬類型。

近年來，隨著測序技術的發展，對微生物群（微生物組）的研究逐漸加深，研究熱點越來越多集中于環境和生物體相互作用的微生物群。加之測序成本降低，分析技術不斷提升，都使得宏基因組測序技術得到普遍應用。為什么要做宏基因組：宏基因組相對16S來說其物種分辨率會更高，隨著物種測序完成越來越多，數據庫更加完善，在腸道菌群方面基本能實現97%以上的菌都能鑒定到種，90%以上到菌株層面。而且可以同時獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現，可以直接通過大規模宏基因組測序不僅找到可能的菌，進一步還能鑒定出特定候選基因區段。

優化臨床制備病毒宏基因組測序樣本的方法：①介紹高通量病毒宏基因組測序的樣本制備步驟，對臨床樣本的總核酸進行隨機擴增；②檢測了從血漿樣本中富集/擴增DNA及RNA病毒的不同方法，一種包括過濾、核酸酶消化、在不同反應中隨機擴增DNA及RNA的步驟是較好的；③隨后在包含了不同病毒科的樣本中驗證此方法，可高讀數地檢測到大多數病毒序列，且優于現行的其它樣本制備方法；④該方法不僅適用于血漿樣本，還可用于尿液、咽喉拭子等臨床樣本。宏基因組測序技術不依賴于微生物的分離培養。

宏基因組測序的挑戰：背景干擾，病原樣本深藏在大量宿主和其它微生物之內，臨床病原常為起始量低，背景噪音大的復雜樣本，大量宿主信號掩蓋了微量病原信號，致使敏感性偏低，難以有效區分。另外，因為RNA病毒需先轉化為互補DNA(cDNA)再進行測序，因此病原宏基因組測序技術對RNA病原體檢出率比DNA病毒更低。可以考慮對核酸樣本進行特殊的處理，對病毒序列進行特異性富集，再進行建庫測序。質量控制：病原宏基因組測序技術涉及一系列繁瑣的實驗操作過程，例如文庫構建涉及到基因組打斷，測序接頭鏈接，全基因組擴增等多個步驟，每一步驟的目標是要每個分子都以相同的效率執行每個步驟，打斷有損失，連接有差別，擴增有偏好，都會帶來檢測誤差。宏基因組測序以特定環境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進行分離培養。浙江皮膚微生物多樣性測序分析排行

病原微生物二代測序也稱宏基因組測序（mNGS）是目前臨床上針對病原常用的基因測序方法。長沙水體微生物分析多少錢

病毒宏基因組學（Viralmetagenomics）是宏基因組學的一個分支，指研究特定環境中的病毒群落的一門技術。近年來隨著新測序技術的不斷發展，尤其是第二代、第三代測序儀的出現，使病毒宏基因組學發展尤為迅速。對海洋中病毒群體進行了研究，闡明海水中病毒群體以噬菌體為主，并且是應用宏基因組學分析人糞便中不能培養的病毒群落，標志病毒宏基因組學的開端。病毒宏基因組學這一概念，其描述的是環境中的病毒群落―噬菌體。再次提到病毒宏基因組學這一概念，并對宏基因組學挖掘新病毒的方法進行了闡述，側重于人和動物機體中的真核病毒群落。長沙水體微生物分析多少錢