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每隔2天用電阻儀測量細胞跨膜電阻值，直到達到平臺，提示細胞已經形成致密單層；或者通過檢測熒光染料熒光黃的通過率，以判斷細胞剛好完全匯合。電阻儀測量因不傷害細胞，可以繼續培養而比熒光黃法更為普遍地被采用。細胞單層匯合后，用DPBS清洗一次細胞，加入含有不同濃度藥物（一般10-200μM）的緩沖液。如果要測藥物從上至下的運輸效果，則上層小室中加藥物，下層培養板孔里只加緩沖液；反之則相反。將培養板在37℃條件下培養（60rpm震蕩或者不震蕩）1-2h，到達時間之后，分別從細胞小室和培養孔里取出一定 體積緩沖液（一般50μL ）轉移至新的轉運分析板進行LC/MC分析。對于放射性標記藥物，分別取出20μL緩沖液加入100μL閃爍液，通過多孔閃爍讀板儀讀值。

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